Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FAM20AQ96MK3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
FAM20AQ96MK3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FAM20AQ96MK3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FAM20AQ96MK3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FAM20AQ96MK3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FAM20AQ96MK3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FAM20AQ96MK3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FAM20AQ96MK3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FAM20AQ96MK3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FAM20AQ96MK3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FAM20AQ96MK3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FAM20AQ96MK3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FAM20AQ96MK3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FAM20AQ96MK3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FAM20AQ96MK3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FAM20AQ96MK3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FAM20AQ96MK3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FAM20AQ96MK3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FAM20AQ96MK3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FAM20AQ96MK3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FAM20AQ96MK3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FAM20AQ96MK3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FAM20AQ96MK3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FAM20AQ96MK3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FAM20AQ96MK3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
FAM20AQ96MK3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FAM20AQ96MK3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FAM20AQ96MK3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FAM20AQ96MK3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FAM20AQ96MK3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FAM20AQ96MK3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FAM20AQ96MK3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
FAM20AQ96MK3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FAM20AQ96MK3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FAM20AQ96MK3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
FAM20AQ96MK3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FAM20AQ96MK3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FAM20AQ96MK3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FAM20AQ96MK3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FAM20AQ96MK3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FAM20AQ96MK3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FAM20AQ96MK3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FAM20AQ96MK3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FAM20AQ96MK3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FAM20AQ96MK3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FAM20AQ96MK3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FAM20AQ96MK3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FAM20AQ96MK3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FAM20AQ96MK3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FAM20AQ96MK3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FAM20AQ96MK3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
FAM20AQ96MK3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FAM20AQ96MK3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FAM20AQ96MK3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
FAM20AQ96MK3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FAM20AQ96MK3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FAM20AQ96MK3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FAM20AQ96MK3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FAM20AQ96MK3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FAM20AQ96MK3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
FAM20AQ96MK3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FAM20AQ96MK3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
FAM20AQ96MK3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FAM20AQ96MK3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FAM20AQ96MK3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FAM20AQ96MK3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FAM20AQ96MK3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
FAM20AQ96MK3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FAM20AQ96MK3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FAM20AQ96MK3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
FAM20AQ96MK3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FAM20AQ96MK3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FAM20AQ96MK3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FAM20AQ96MK3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FAM20AQ96MK3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
FAM20AQ96MK3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAM20AQ96MK3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FAM20AQ96MK3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FAM20AQ96MK3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
FAM20AQ96MK3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FAM20AQ96MK3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FAM20AQ96MK3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FAM20AQ96MK3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FAM20AQ96MK3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FAM20AQ96MK3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FAM20AQ96MK3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FAM20AQ96MK3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAM20AQ96MK3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAM20AQ96MK3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAM20AQ96MK3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAM20AQ96MK3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FAM20AQ96MK3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FAM20AQ96MK3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
FAM20AQ96MK3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FAM20AQ96MK3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
FAM20AQ96MK3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
FAM20AQ96MK3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
FAM20AQ96MK3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FAM20AQ96MK3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms