Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SHDQ96IW2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHDQ96IW2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SHDQ96IW2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHDQ96IW2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SHDQ96IW2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHDQ96IW2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHDQ96IW2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHDQ96IW2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHDQ96IW2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHDQ96IW2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHDQ96IW2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHDQ96IW2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SHDQ96IW2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHDQ96IW2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHDQ96IW2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHDQ96IW2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHDQ96IW2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHDQ96IW2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHDQ96IW2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHDQ96IW2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHDQ96IW2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHDQ96IW2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHDQ96IW2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SHDQ96IW2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHDQ96IW2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHDQ96IW2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHDQ96IW2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SHDQ96IW2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHDQ96IW2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHDQ96IW2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHDQ96IW2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHDQ96IW2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHDQ96IW2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHDQ96IW2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHDQ96IW2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHDQ96IW2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHDQ96IW2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHDQ96IW2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHDQ96IW2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHDQ96IW2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHDQ96IW2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHDQ96IW2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHDQ96IW2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHDQ96IW2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHDQ96IW2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHDQ96IW2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHDQ96IW2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHDQ96IW2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHDQ96IW2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHDQ96IW2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHDQ96IW2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHDQ96IW2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHDQ96IW2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHDQ96IW2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHDQ96IW2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHDQ96IW2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHDQ96IW2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHDQ96IW2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHDQ96IW2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHDQ96IW2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHDQ96IW2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHDQ96IW2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHDQ96IW2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHDQ96IW2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHDQ96IW2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHDQ96IW2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHDQ96IW2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHDQ96IW2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHDQ96IW2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHDQ96IW2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHDQ96IW2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHDQ96IW2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHDQ96IW2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHDQ96IW2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHDQ96IW2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHDQ96IW2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHDQ96IW2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHDQ96IW2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHDQ96IW2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SHDQ96IW2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHDQ96IW2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHDQ96IW2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHDQ96IW2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHDQ96IW2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHDQ96IW2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHDQ96IW2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHDQ96IW2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SHDQ96IW2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SHDQ96IW2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHDQ96IW2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHDQ96IW2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHDQ96IW2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHDQ96IW2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHDQ96IW2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHDQ96IW2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHDQ96IW2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHDQ96IW2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHDQ96IW2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHDQ96IW2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms