Protein–RNA interactions for Protein: Q96GZ6

SLC41A3, Solute carrier family 41 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A3Q96GZ6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC41A3Q96GZ6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC41A3Q96GZ6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC41A3Q96GZ6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC41A3Q96GZ6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC41A3Q96GZ6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC41A3Q96GZ6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC41A3Q96GZ6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC41A3Q96GZ6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC41A3Q96GZ6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC41A3Q96GZ6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC41A3Q96GZ6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC41A3Q96GZ6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC41A3Q96GZ6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC41A3Q96GZ6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC41A3Q96GZ6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC41A3Q96GZ6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC41A3Q96GZ6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC41A3Q96GZ6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC41A3Q96GZ6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC41A3Q96GZ6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC41A3Q96GZ6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC41A3Q96GZ6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC41A3Q96GZ6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC41A3Q96GZ6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC41A3Q96GZ6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC41A3Q96GZ6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC41A3Q96GZ6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC41A3Q96GZ6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC41A3Q96GZ6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC41A3Q96GZ6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC41A3Q96GZ6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC41A3Q96GZ6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC41A3Q96GZ6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC41A3Q96GZ6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC41A3Q96GZ6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC41A3Q96GZ6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC41A3Q96GZ6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC41A3Q96GZ6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC41A3Q96GZ6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC41A3Q96GZ6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC41A3Q96GZ6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC41A3Q96GZ6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC41A3Q96GZ6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC41A3Q96GZ6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC41A3Q96GZ6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC41A3Q96GZ6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC41A3Q96GZ6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC41A3Q96GZ6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC41A3Q96GZ6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC41A3Q96GZ6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC41A3Q96GZ6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC41A3Q96GZ6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC41A3Q96GZ6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC41A3Q96GZ6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC41A3Q96GZ6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC41A3Q96GZ6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC41A3Q96GZ6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC41A3Q96GZ6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC41A3Q96GZ6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC41A3Q96GZ6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC41A3Q96GZ6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC41A3Q96GZ6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC41A3Q96GZ6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC41A3Q96GZ6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC41A3Q96GZ6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC41A3Q96GZ6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC41A3Q96GZ6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC41A3Q96GZ6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC41A3Q96GZ6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC41A3Q96GZ6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC41A3Q96GZ6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC41A3Q96GZ6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC41A3Q96GZ6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC41A3Q96GZ6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC41A3Q96GZ6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC41A3Q96GZ6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC41A3Q96GZ6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC41A3Q96GZ6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC41A3Q96GZ6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC41A3Q96GZ6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC41A3Q96GZ6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC41A3Q96GZ6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC41A3Q96GZ6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC41A3Q96GZ6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC41A3Q96GZ6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC41A3Q96GZ6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC41A3Q96GZ6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC41A3Q96GZ6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC41A3Q96GZ6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC41A3Q96GZ6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC41A3Q96GZ6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC41A3Q96GZ6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC41A3Q96GZ6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC41A3Q96GZ6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC41A3Q96GZ6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC41A3Q96GZ6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC41A3Q96GZ6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC41A3Q96GZ6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC41A3Q96GZ6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms