Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC5

MRPL48, 39S ribosomal protein L48, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL48Q96GC5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL48Q96GC5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL48Q96GC5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL48Q96GC5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL48Q96GC5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL48Q96GC5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL48Q96GC5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL48Q96GC5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL48Q96GC5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL48Q96GC5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL48Q96GC5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL48Q96GC5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL48Q96GC5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL48Q96GC5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL48Q96GC5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL48Q96GC5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL48Q96GC5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL48Q96GC5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL48Q96GC5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL48Q96GC5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL48Q96GC5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL48Q96GC5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL48Q96GC5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL48Q96GC5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL48Q96GC5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL48Q96GC5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL48Q96GC5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL48Q96GC5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL48Q96GC5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL48Q96GC5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL48Q96GC5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL48Q96GC5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL48Q96GC5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL48Q96GC5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL48Q96GC5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL48Q96GC5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL48Q96GC5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL48Q96GC5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL48Q96GC5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL48Q96GC5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL48Q96GC5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL48Q96GC5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL48Q96GC5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL48Q96GC5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL48Q96GC5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL48Q96GC5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL48Q96GC5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL48Q96GC5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MRPL48Q96GC5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL48Q96GC5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL48Q96GC5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL48Q96GC5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL48Q96GC5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL48Q96GC5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL48Q96GC5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL48Q96GC5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL48Q96GC5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL48Q96GC5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL48Q96GC5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL48Q96GC5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL48Q96GC5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL48Q96GC5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL48Q96GC5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL48Q96GC5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL48Q96GC5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL48Q96GC5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL48Q96GC5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL48Q96GC5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL48Q96GC5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL48Q96GC5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL48Q96GC5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL48Q96GC5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL48Q96GC5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL48Q96GC5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL48Q96GC5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL48Q96GC5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL48Q96GC5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL48Q96GC5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL48Q96GC5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL48Q96GC5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL48Q96GC5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL48Q96GC5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL48Q96GC5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL48Q96GC5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL48Q96GC5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL48Q96GC5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL48Q96GC5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL48Q96GC5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL48Q96GC5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL48Q96GC5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL48Q96GC5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL48Q96GC5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL48Q96GC5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL48Q96GC5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL48Q96GC5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL48Q96GC5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL48Q96GC5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL48Q96GC5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL48Q96GC5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL48Q96GC5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms