Protein–RNA interactions for Protein: Q96FX7

TRMT61A, tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase catalytic subunit TRMT61A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT61AQ96FX7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT61AQ96FX7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRMT61AQ96FX7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT61AQ96FX7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT61AQ96FX7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT61AQ96FX7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT61AQ96FX7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT61AQ96FX7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT61AQ96FX7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT61AQ96FX7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT61AQ96FX7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT61AQ96FX7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT61AQ96FX7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT61AQ96FX7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT61AQ96FX7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT61AQ96FX7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT61AQ96FX7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT61AQ96FX7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT61AQ96FX7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT61AQ96FX7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT61AQ96FX7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT61AQ96FX7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT61AQ96FX7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT61AQ96FX7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT61AQ96FX7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT61AQ96FX7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT61AQ96FX7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT61AQ96FX7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT61AQ96FX7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT61AQ96FX7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT61AQ96FX7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT61AQ96FX7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT61AQ96FX7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT61AQ96FX7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT61AQ96FX7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT61AQ96FX7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMT61AQ96FX7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMT61AQ96FX7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMT61AQ96FX7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMT61AQ96FX7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMT61AQ96FX7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMT61AQ96FX7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRMT61AQ96FX7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRMT61AQ96FX7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRMT61AQ96FX7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRMT61AQ96FX7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRMT61AQ96FX7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRMT61AQ96FX7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRMT61AQ96FX7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRMT61AQ96FX7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRMT61AQ96FX7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRMT61AQ96FX7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRMT61AQ96FX7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRMT61AQ96FX7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRMT61AQ96FX7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRMT61AQ96FX7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRMT61AQ96FX7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRMT61AQ96FX7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRMT61AQ96FX7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRMT61AQ96FX7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRMT61AQ96FX7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRMT61AQ96FX7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRMT61AQ96FX7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRMT61AQ96FX7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRMT61AQ96FX7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRMT61AQ96FX7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRMT61AQ96FX7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRMT61AQ96FX7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRMT61AQ96FX7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRMT61AQ96FX7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRMT61AQ96FX7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRMT61AQ96FX7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRMT61AQ96FX7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRMT61AQ96FX7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT61AQ96FX7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT61AQ96FX7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT61AQ96FX7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT61AQ96FX7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMT61AQ96FX7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMT61AQ96FX7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT61AQ96FX7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT61AQ96FX7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT61AQ96FX7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT61AQ96FX7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT61AQ96FX7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT61AQ96FX7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT61AQ96FX7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT61AQ96FX7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT61AQ96FX7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT61AQ96FX7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT61AQ96FX7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT61AQ96FX7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT61AQ96FX7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT61AQ96FX7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT61AQ96FX7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT61AQ96FX7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT61AQ96FX7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT61AQ96FX7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT61AQ96FX7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT61AQ96FX7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms