Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ASIC4Q96FT7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ASIC4Q96FT7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ASIC4Q96FT7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ASIC4Q96FT7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ASIC4Q96FT7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ASIC4Q96FT7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ASIC4Q96FT7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ASIC4Q96FT7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ASIC4Q96FT7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ASIC4Q96FT7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ASIC4Q96FT7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ASIC4Q96FT7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ASIC4Q96FT7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ASIC4Q96FT7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ASIC4Q96FT7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ASIC4Q96FT7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ASIC4Q96FT7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ASIC4Q96FT7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ASIC4Q96FT7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ASIC4Q96FT7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ASIC4Q96FT7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ASIC4Q96FT7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ASIC4Q96FT7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ASIC4Q96FT7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ASIC4Q96FT7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ASIC4Q96FT7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ASIC4Q96FT7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ASIC4Q96FT7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ASIC4Q96FT7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ASIC4Q96FT7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ASIC4Q96FT7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ASIC4Q96FT7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ASIC4Q96FT7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ASIC4Q96FT7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ASIC4Q96FT7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ASIC4Q96FT7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ASIC4Q96FT7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ASIC4Q96FT7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ASIC4Q96FT7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ASIC4Q96FT7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ASIC4Q96FT7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ASIC4Q96FT7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ASIC4Q96FT7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ASIC4Q96FT7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ASIC4Q96FT7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ASIC4Q96FT7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ASIC4Q96FT7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ASIC4Q96FT7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ASIC4Q96FT7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ASIC4Q96FT7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ASIC4Q96FT7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ASIC4Q96FT7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ASIC4Q96FT7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ASIC4Q96FT7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ASIC4Q96FT7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ASIC4Q96FT7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ASIC4Q96FT7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ASIC4Q96FT7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ASIC4Q96FT7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ASIC4Q96FT7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ASIC4Q96FT7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ASIC4Q96FT7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ASIC4Q96FT7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ASIC4Q96FT7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ASIC4Q96FT7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ASIC4Q96FT7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ASIC4Q96FT7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ASIC4Q96FT7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ASIC4Q96FT7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ASIC4Q96FT7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ASIC4Q96FT7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ASIC4Q96FT7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ASIC4Q96FT7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ASIC4Q96FT7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ASIC4Q96FT7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ASIC4Q96FT7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ASIC4Q96FT7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ASIC4Q96FT7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ASIC4Q96FT7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ASIC4Q96FT7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ASIC4Q96FT7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ASIC4Q96FT7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ASIC4Q96FT7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ASIC4Q96FT7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ASIC4Q96FT7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ASIC4Q96FT7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ASIC4Q96FT7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ASIC4Q96FT7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ASIC4Q96FT7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ASIC4Q96FT7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ASIC4Q96FT7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ASIC4Q96FT7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ASIC4Q96FT7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ASIC4Q96FT7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ASIC4Q96FT7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ASIC4Q96FT7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ASIC4Q96FT7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ASIC4Q96FT7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ASIC4Q96FT7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms