Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
SIRT1Q96EB6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SIRT1Q96EB6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SIRT1Q96EB6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SIRT1Q96EB6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SIRT1Q96EB6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SIRT1Q96EB6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SIRT1Q96EB6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SIRT1Q96EB6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.48
SIRT1Q96EB6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
SIRT1Q96EB6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SIRT1Q96EB6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SIRT1Q96EB6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SIRT1Q96EB6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SIRT1Q96EB6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SIRT1Q96EB6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SIRT1Q96EB6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SIRT1Q96EB6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SIRT1Q96EB6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SIRT1Q96EB6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SIRT1Q96EB6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
SIRT1Q96EB6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SIRT1Q96EB6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SIRT1Q96EB6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SIRT1Q96EB6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SIRT1Q96EB6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SIRT1Q96EB6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SIRT1Q96EB6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SIRT1Q96EB6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SIRT1Q96EB6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SIRT1Q96EB6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SIRT1Q96EB6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SIRT1Q96EB6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
SIRT1Q96EB6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SIRT1Q96EB6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SIRT1Q96EB6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SIRT1Q96EB6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SIRT1Q96EB6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SIRT1Q96EB6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SIRT1Q96EB6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SIRT1Q96EB6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SIRT1Q96EB6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SIRT1Q96EB6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SIRT1Q96EB6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
SIRT1Q96EB6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SIRT1Q96EB6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
SIRT1Q96EB6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SIRT1Q96EB6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SIRT1Q96EB6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SIRT1Q96EB6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
SIRT1Q96EB6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SIRT1Q96EB6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SIRT1Q96EB6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SIRT1Q96EB6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SIRT1Q96EB6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SIRT1Q96EB6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SIRT1Q96EB6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SIRT1Q96EB6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SIRT1Q96EB6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
SIRT1Q96EB6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SIRT1Q96EB6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SIRT1Q96EB6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SIRT1Q96EB6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SIRT1Q96EB6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
SIRT1Q96EB6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SIRT1Q96EB6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SIRT1Q96EB6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SIRT1Q96EB6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
SIRT1Q96EB6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SIRT1Q96EB6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SIRT1Q96EB6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SIRT1Q96EB6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SIRT1Q96EB6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SIRT1Q96EB6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SIRT1Q96EB6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SIRT1Q96EB6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SIRT1Q96EB6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SIRT1Q96EB6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
SIRT1Q96EB6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SIRT1Q96EB6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SIRT1Q96EB6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SIRT1Q96EB6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SIRT1Q96EB6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SIRT1Q96EB6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SIRT1Q96EB6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SIRT1Q96EB6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SIRT1Q96EB6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SIRT1Q96EB6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SIRT1Q96EB6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SIRT1Q96EB6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SIRT1Q96EB6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
SIRT1Q96EB6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SIRT1Q96EB6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SIRT1Q96EB6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SIRT1Q96EB6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SIRT1Q96EB6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SIRT1Q96EB6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SIRT1Q96EB6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SIRT1Q96EB6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
SIRT1Q96EB6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms