Protein–RNA interactions for Protein: Q92753

RORB, Nuclear receptor ROR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORBQ92753 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RORBQ92753 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RORBQ92753 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RORBQ92753 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RORBQ92753 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RORBQ92753 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RORBQ92753 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RORBQ92753 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RORBQ92753 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RORBQ92753 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RORBQ92753 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RORBQ92753 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RORBQ92753 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RORBQ92753 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RORBQ92753 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RORBQ92753 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RORBQ92753 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RORBQ92753 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RORBQ92753 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RORBQ92753 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RORBQ92753 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RORBQ92753 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RORBQ92753 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RORBQ92753 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RORBQ92753 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RORBQ92753 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RORBQ92753 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RORBQ92753 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RORBQ92753 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RORBQ92753 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RORBQ92753 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RORBQ92753 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RORBQ92753 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RORBQ92753 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RORBQ92753 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RORBQ92753 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RORBQ92753 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RORBQ92753 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RORBQ92753 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RORBQ92753 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RORBQ92753 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RORBQ92753 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RORBQ92753 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RORBQ92753 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RORBQ92753 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RORBQ92753 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RORBQ92753 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RORBQ92753 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RORBQ92753 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RORBQ92753 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RORBQ92753 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RORBQ92753 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RORBQ92753 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RORBQ92753 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RORBQ92753 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RORBQ92753 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RORBQ92753 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RORBQ92753 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RORBQ92753 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RORBQ92753 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RORBQ92753 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RORBQ92753 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RORBQ92753 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RORBQ92753 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RORBQ92753 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RORBQ92753 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RORBQ92753 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RORBQ92753 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RORBQ92753 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RORBQ92753 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RORBQ92753 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RORBQ92753 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RORBQ92753 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RORBQ92753 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RORBQ92753 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RORBQ92753 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RORBQ92753 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RORBQ92753 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RORBQ92753 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RORBQ92753 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RORBQ92753 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RORBQ92753 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RORBQ92753 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RORBQ92753 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RORBQ92753 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RORBQ92753 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RORBQ92753 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RORBQ92753 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RORBQ92753 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RORBQ92753 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RORBQ92753 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RORBQ92753 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RORBQ92753 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RORBQ92753 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RORBQ92753 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RORBQ92753 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RORBQ92753 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RORBQ92753 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RORBQ92753 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RORBQ92753 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms