Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVS4

WDR60, WD repeat-containing protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR60Q8WVS4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
WDR60Q8WVS4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
WDR60Q8WVS4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
WDR60Q8WVS4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
WDR60Q8WVS4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
WDR60Q8WVS4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
WDR60Q8WVS4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
WDR60Q8WVS4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WDR60Q8WVS4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WDR60Q8WVS4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WDR60Q8WVS4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
WDR60Q8WVS4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WDR60Q8WVS4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
WDR60Q8WVS4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
WDR60Q8WVS4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WDR60Q8WVS4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
WDR60Q8WVS4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
WDR60Q8WVS4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
WDR60Q8WVS4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
WDR60Q8WVS4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
WDR60Q8WVS4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
WDR60Q8WVS4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR60Q8WVS4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR60Q8WVS4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR60Q8WVS4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
WDR60Q8WVS4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
WDR60Q8WVS4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
WDR60Q8WVS4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
WDR60Q8WVS4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
WDR60Q8WVS4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
WDR60Q8WVS4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
WDR60Q8WVS4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
WDR60Q8WVS4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
WDR60Q8WVS4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WDR60Q8WVS4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
WDR60Q8WVS4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR60Q8WVS4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR60Q8WVS4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR60Q8WVS4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR60Q8WVS4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR60Q8WVS4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR60Q8WVS4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR60Q8WVS4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR60Q8WVS4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR60Q8WVS4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR60Q8WVS4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR60Q8WVS4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
WDR60Q8WVS4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR60Q8WVS4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR60Q8WVS4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR60Q8WVS4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR60Q8WVS4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR60Q8WVS4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR60Q8WVS4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR60Q8WVS4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR60Q8WVS4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR60Q8WVS4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR60Q8WVS4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR60Q8WVS4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR60Q8WVS4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR60Q8WVS4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR60Q8WVS4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR60Q8WVS4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR60Q8WVS4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR60Q8WVS4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR60Q8WVS4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR60Q8WVS4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
WDR60Q8WVS4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR60Q8WVS4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR60Q8WVS4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR60Q8WVS4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR60Q8WVS4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR60Q8WVS4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR60Q8WVS4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR60Q8WVS4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR60Q8WVS4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR60Q8WVS4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR60Q8WVS4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR60Q8WVS4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR60Q8WVS4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR60Q8WVS4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR60Q8WVS4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR60Q8WVS4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR60Q8WVS4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR60Q8WVS4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR60Q8WVS4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR60Q8WVS4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR60Q8WVS4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR60Q8WVS4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR60Q8WVS4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR60Q8WVS4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR60Q8WVS4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR60Q8WVS4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
WDR60Q8WVS4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
WDR60Q8WVS4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR60Q8WVS4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR60Q8WVS4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR60Q8WVS4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR60Q8WVS4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR60Q8WVS4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms