Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEZ2

VPS37A, Vacuolar protein sorting-associated protein 37A, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37AQ8NEZ2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS37AQ8NEZ2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS37AQ8NEZ2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS37AQ8NEZ2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS37AQ8NEZ2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS37AQ8NEZ2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS37AQ8NEZ2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS37AQ8NEZ2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS37AQ8NEZ2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS37AQ8NEZ2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS37AQ8NEZ2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS37AQ8NEZ2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS37AQ8NEZ2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS37AQ8NEZ2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS37AQ8NEZ2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS37AQ8NEZ2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS37AQ8NEZ2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS37AQ8NEZ2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS37AQ8NEZ2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS37AQ8NEZ2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS37AQ8NEZ2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS37AQ8NEZ2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS37AQ8NEZ2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS37AQ8NEZ2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS37AQ8NEZ2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS37AQ8NEZ2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS37AQ8NEZ2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS37AQ8NEZ2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS37AQ8NEZ2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS37AQ8NEZ2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS37AQ8NEZ2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS37AQ8NEZ2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VPS37AQ8NEZ2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS37AQ8NEZ2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS37AQ8NEZ2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS37AQ8NEZ2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS37AQ8NEZ2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS37AQ8NEZ2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS37AQ8NEZ2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS37AQ8NEZ2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS37AQ8NEZ2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS37AQ8NEZ2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS37AQ8NEZ2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS37AQ8NEZ2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS37AQ8NEZ2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS37AQ8NEZ2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS37AQ8NEZ2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS37AQ8NEZ2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS37AQ8NEZ2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS37AQ8NEZ2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS37AQ8NEZ2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS37AQ8NEZ2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS37AQ8NEZ2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS37AQ8NEZ2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS37AQ8NEZ2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS37AQ8NEZ2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS37AQ8NEZ2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS37AQ8NEZ2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS37AQ8NEZ2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS37AQ8NEZ2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS37AQ8NEZ2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS37AQ8NEZ2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS37AQ8NEZ2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS37AQ8NEZ2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS37AQ8NEZ2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS37AQ8NEZ2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37AQ8NEZ2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37AQ8NEZ2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37AQ8NEZ2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37AQ8NEZ2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37AQ8NEZ2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS37AQ8NEZ2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS37AQ8NEZ2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS37AQ8NEZ2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS37AQ8NEZ2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS37AQ8NEZ2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS37AQ8NEZ2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS37AQ8NEZ2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS37AQ8NEZ2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS37AQ8NEZ2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS37AQ8NEZ2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS37AQ8NEZ2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS37AQ8NEZ2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS37AQ8NEZ2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS37AQ8NEZ2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS37AQ8NEZ2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS37AQ8NEZ2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS37AQ8NEZ2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS37AQ8NEZ2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS37AQ8NEZ2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37AQ8NEZ2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37AQ8NEZ2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37AQ8NEZ2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37AQ8NEZ2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37AQ8NEZ2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37AQ8NEZ2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37AQ8NEZ2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37AQ8NEZ2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37AQ8NEZ2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37AQ8NEZ2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.1 ms