Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF9

SRFBP1, Serum response factor-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFBP1Q8NEF9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SRFBP1Q8NEF9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRFBP1Q8NEF9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRFBP1Q8NEF9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRFBP1Q8NEF9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRFBP1Q8NEF9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRFBP1Q8NEF9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRFBP1Q8NEF9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRFBP1Q8NEF9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRFBP1Q8NEF9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRFBP1Q8NEF9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRFBP1Q8NEF9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRFBP1Q8NEF9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRFBP1Q8NEF9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRFBP1Q8NEF9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRFBP1Q8NEF9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRFBP1Q8NEF9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRFBP1Q8NEF9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRFBP1Q8NEF9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SRFBP1Q8NEF9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRFBP1Q8NEF9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRFBP1Q8NEF9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRFBP1Q8NEF9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRFBP1Q8NEF9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SRFBP1Q8NEF9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRFBP1Q8NEF9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SRFBP1Q8NEF9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRFBP1Q8NEF9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRFBP1Q8NEF9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRFBP1Q8NEF9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRFBP1Q8NEF9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRFBP1Q8NEF9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRFBP1Q8NEF9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRFBP1Q8NEF9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRFBP1Q8NEF9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRFBP1Q8NEF9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRFBP1Q8NEF9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRFBP1Q8NEF9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRFBP1Q8NEF9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRFBP1Q8NEF9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRFBP1Q8NEF9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRFBP1Q8NEF9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRFBP1Q8NEF9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRFBP1Q8NEF9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRFBP1Q8NEF9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRFBP1Q8NEF9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRFBP1Q8NEF9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRFBP1Q8NEF9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRFBP1Q8NEF9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRFBP1Q8NEF9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SRFBP1Q8NEF9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRFBP1Q8NEF9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRFBP1Q8NEF9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRFBP1Q8NEF9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRFBP1Q8NEF9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRFBP1Q8NEF9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRFBP1Q8NEF9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRFBP1Q8NEF9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRFBP1Q8NEF9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRFBP1Q8NEF9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRFBP1Q8NEF9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SRFBP1Q8NEF9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRFBP1Q8NEF9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRFBP1Q8NEF9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRFBP1Q8NEF9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRFBP1Q8NEF9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRFBP1Q8NEF9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SRFBP1Q8NEF9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRFBP1Q8NEF9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRFBP1Q8NEF9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRFBP1Q8NEF9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRFBP1Q8NEF9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRFBP1Q8NEF9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRFBP1Q8NEF9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRFBP1Q8NEF9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRFBP1Q8NEF9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRFBP1Q8NEF9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRFBP1Q8NEF9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRFBP1Q8NEF9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRFBP1Q8NEF9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRFBP1Q8NEF9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRFBP1Q8NEF9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRFBP1Q8NEF9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRFBP1Q8NEF9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRFBP1Q8NEF9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRFBP1Q8NEF9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRFBP1Q8NEF9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SRFBP1Q8NEF9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRFBP1Q8NEF9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SRFBP1Q8NEF9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRFBP1Q8NEF9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRFBP1Q8NEF9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRFBP1Q8NEF9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRFBP1Q8NEF9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRFBP1Q8NEF9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRFBP1Q8NEF9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRFBP1Q8NEF9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRFBP1Q8NEF9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRFBP1Q8NEF9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRFBP1Q8NEF9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms