Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3L3

TXLNB, Beta-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNBQ8N3L3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TXLNBQ8N3L3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TXLNBQ8N3L3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TXLNBQ8N3L3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TXLNBQ8N3L3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TXLNBQ8N3L3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TXLNBQ8N3L3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TXLNBQ8N3L3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TXLNBQ8N3L3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TXLNBQ8N3L3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TXLNBQ8N3L3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TXLNBQ8N3L3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TXLNBQ8N3L3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TXLNBQ8N3L3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TXLNBQ8N3L3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TXLNBQ8N3L3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TXLNBQ8N3L3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TXLNBQ8N3L3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TXLNBQ8N3L3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TXLNBQ8N3L3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TXLNBQ8N3L3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TXLNBQ8N3L3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TXLNBQ8N3L3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TXLNBQ8N3L3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TXLNBQ8N3L3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TXLNBQ8N3L3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TXLNBQ8N3L3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TXLNBQ8N3L3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TXLNBQ8N3L3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TXLNBQ8N3L3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TXLNBQ8N3L3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TXLNBQ8N3L3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TXLNBQ8N3L3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TXLNBQ8N3L3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TXLNBQ8N3L3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TXLNBQ8N3L3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TXLNBQ8N3L3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TXLNBQ8N3L3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TXLNBQ8N3L3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TXLNBQ8N3L3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TXLNBQ8N3L3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TXLNBQ8N3L3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TXLNBQ8N3L3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TXLNBQ8N3L3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TXLNBQ8N3L3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TXLNBQ8N3L3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TXLNBQ8N3L3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TXLNBQ8N3L3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TXLNBQ8N3L3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TXLNBQ8N3L3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TXLNBQ8N3L3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TXLNBQ8N3L3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TXLNBQ8N3L3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TXLNBQ8N3L3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TXLNBQ8N3L3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TXLNBQ8N3L3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TXLNBQ8N3L3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXLNBQ8N3L3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXLNBQ8N3L3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXLNBQ8N3L3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXLNBQ8N3L3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXLNBQ8N3L3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXLNBQ8N3L3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXLNBQ8N3L3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TXLNBQ8N3L3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TXLNBQ8N3L3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TXLNBQ8N3L3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TXLNBQ8N3L3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TXLNBQ8N3L3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TXLNBQ8N3L3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TXLNBQ8N3L3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TXLNBQ8N3L3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TXLNBQ8N3L3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TXLNBQ8N3L3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TXLNBQ8N3L3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TXLNBQ8N3L3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TXLNBQ8N3L3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TXLNBQ8N3L3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TXLNBQ8N3L3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TXLNBQ8N3L3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TXLNBQ8N3L3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TXLNBQ8N3L3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TXLNBQ8N3L3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TXLNBQ8N3L3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TXLNBQ8N3L3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TXLNBQ8N3L3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TXLNBQ8N3L3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TXLNBQ8N3L3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TXLNBQ8N3L3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TXLNBQ8N3L3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TXLNBQ8N3L3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TXLNBQ8N3L3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TXLNBQ8N3L3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TXLNBQ8N3L3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TXLNBQ8N3L3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TXLNBQ8N3L3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TXLNBQ8N3L3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TXLNBQ8N3L3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TXLNBQ8N3L3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TXLNBQ8N3L3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms