Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
SKAP1Q86WV1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SKAP1Q86WV1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SKAP1Q86WV1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SKAP1Q86WV1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SKAP1Q86WV1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SKAP1Q86WV1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SKAP1Q86WV1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SKAP1Q86WV1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SKAP1Q86WV1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SKAP1Q86WV1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SKAP1Q86WV1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SKAP1Q86WV1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SKAP1Q86WV1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SKAP1Q86WV1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SKAP1Q86WV1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SKAP1Q86WV1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SKAP1Q86WV1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SKAP1Q86WV1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SKAP1Q86WV1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SKAP1Q86WV1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SKAP1Q86WV1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SKAP1Q86WV1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
SKAP1Q86WV1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SKAP1Q86WV1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SKAP1Q86WV1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SKAP1Q86WV1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
SKAP1Q86WV1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SKAP1Q86WV1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SKAP1Q86WV1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SKAP1Q86WV1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SKAP1Q86WV1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SKAP1Q86WV1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SKAP1Q86WV1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
SKAP1Q86WV1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SKAP1Q86WV1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SKAP1Q86WV1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SKAP1Q86WV1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SKAP1Q86WV1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SKAP1Q86WV1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SKAP1Q86WV1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SKAP1Q86WV1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SKAP1Q86WV1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SKAP1Q86WV1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SKAP1Q86WV1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SKAP1Q86WV1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SKAP1Q86WV1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SKAP1Q86WV1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SKAP1Q86WV1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SKAP1Q86WV1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SKAP1Q86WV1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SKAP1Q86WV1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SKAP1Q86WV1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SKAP1Q86WV1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SKAP1Q86WV1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SKAP1Q86WV1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SKAP1Q86WV1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SKAP1Q86WV1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SKAP1Q86WV1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SKAP1Q86WV1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SKAP1Q86WV1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SKAP1Q86WV1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SKAP1Q86WV1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SKAP1Q86WV1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SKAP1Q86WV1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SKAP1Q86WV1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SKAP1Q86WV1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SKAP1Q86WV1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
SKAP1Q86WV1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SKAP1Q86WV1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SKAP1Q86WV1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SKAP1Q86WV1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SKAP1Q86WV1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SKAP1Q86WV1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SKAP1Q86WV1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
SKAP1Q86WV1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SKAP1Q86WV1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SKAP1Q86WV1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SKAP1Q86WV1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SKAP1Q86WV1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SKAP1Q86WV1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SKAP1Q86WV1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SKAP1Q86WV1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SKAP1Q86WV1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SKAP1Q86WV1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SKAP1Q86WV1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SKAP1Q86WV1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SKAP1Q86WV1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SKAP1Q86WV1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SKAP1Q86WV1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SKAP1Q86WV1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SKAP1Q86WV1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
SKAP1Q86WV1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SKAP1Q86WV1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SKAP1Q86WV1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SKAP1Q86WV1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SKAP1Q86WV1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SKAP1Q86WV1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SKAP1Q86WV1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SKAP1Q86WV1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms