Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLNKQ7Z7G1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLNKQ7Z7G1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLNKQ7Z7G1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLNKQ7Z7G1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLNKQ7Z7G1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLNKQ7Z7G1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLNKQ7Z7G1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLNKQ7Z7G1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLNKQ7Z7G1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLNKQ7Z7G1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLNKQ7Z7G1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLNKQ7Z7G1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLNKQ7Z7G1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLNKQ7Z7G1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLNKQ7Z7G1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLNKQ7Z7G1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLNKQ7Z7G1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLNKQ7Z7G1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLNKQ7Z7G1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLNKQ7Z7G1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLNKQ7Z7G1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLNKQ7Z7G1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLNKQ7Z7G1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLNKQ7Z7G1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CLNKQ7Z7G1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLNKQ7Z7G1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLNKQ7Z7G1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLNKQ7Z7G1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLNKQ7Z7G1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLNKQ7Z7G1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CLNKQ7Z7G1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLNKQ7Z7G1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLNKQ7Z7G1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLNKQ7Z7G1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CLNKQ7Z7G1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLNKQ7Z7G1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLNKQ7Z7G1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLNKQ7Z7G1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLNKQ7Z7G1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLNKQ7Z7G1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLNKQ7Z7G1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLNKQ7Z7G1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLNKQ7Z7G1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLNKQ7Z7G1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLNKQ7Z7G1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLNKQ7Z7G1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLNKQ7Z7G1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLNKQ7Z7G1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLNKQ7Z7G1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLNKQ7Z7G1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLNKQ7Z7G1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CLNKQ7Z7G1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLNKQ7Z7G1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLNKQ7Z7G1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLNKQ7Z7G1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLNKQ7Z7G1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLNKQ7Z7G1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLNKQ7Z7G1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLNKQ7Z7G1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLNKQ7Z7G1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLNKQ7Z7G1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLNKQ7Z7G1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLNKQ7Z7G1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLNKQ7Z7G1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLNKQ7Z7G1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLNKQ7Z7G1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLNKQ7Z7G1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLNKQ7Z7G1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLNKQ7Z7G1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLNKQ7Z7G1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLNKQ7Z7G1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLNKQ7Z7G1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLNKQ7Z7G1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLNKQ7Z7G1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLNKQ7Z7G1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLNKQ7Z7G1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CLNKQ7Z7G1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLNKQ7Z7G1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLNKQ7Z7G1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLNKQ7Z7G1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLNKQ7Z7G1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLNKQ7Z7G1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLNKQ7Z7G1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLNKQ7Z7G1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLNKQ7Z7G1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLNKQ7Z7G1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLNKQ7Z7G1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLNKQ7Z7G1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLNKQ7Z7G1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLNKQ7Z7G1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLNKQ7Z7G1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLNKQ7Z7G1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms