Protein–RNA interactions for Protein: Q7M4L6

SHF, SH2 domain-containing adapter protein F, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHFQ7M4L6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHFQ7M4L6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHFQ7M4L6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHFQ7M4L6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHFQ7M4L6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHFQ7M4L6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHFQ7M4L6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHFQ7M4L6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHFQ7M4L6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHFQ7M4L6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHFQ7M4L6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHFQ7M4L6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHFQ7M4L6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHFQ7M4L6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHFQ7M4L6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHFQ7M4L6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHFQ7M4L6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHFQ7M4L6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHFQ7M4L6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHFQ7M4L6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHFQ7M4L6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHFQ7M4L6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHFQ7M4L6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHFQ7M4L6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHFQ7M4L6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SHFQ7M4L6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHFQ7M4L6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHFQ7M4L6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHFQ7M4L6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHFQ7M4L6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHFQ7M4L6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHFQ7M4L6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHFQ7M4L6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHFQ7M4L6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHFQ7M4L6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHFQ7M4L6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHFQ7M4L6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHFQ7M4L6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHFQ7M4L6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHFQ7M4L6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHFQ7M4L6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHFQ7M4L6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHFQ7M4L6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHFQ7M4L6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHFQ7M4L6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHFQ7M4L6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHFQ7M4L6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHFQ7M4L6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHFQ7M4L6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHFQ7M4L6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHFQ7M4L6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHFQ7M4L6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHFQ7M4L6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHFQ7M4L6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHFQ7M4L6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHFQ7M4L6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHFQ7M4L6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHFQ7M4L6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHFQ7M4L6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHFQ7M4L6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHFQ7M4L6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHFQ7M4L6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHFQ7M4L6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHFQ7M4L6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHFQ7M4L6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHFQ7M4L6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHFQ7M4L6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHFQ7M4L6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHFQ7M4L6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHFQ7M4L6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHFQ7M4L6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHFQ7M4L6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHFQ7M4L6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHFQ7M4L6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHFQ7M4L6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHFQ7M4L6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHFQ7M4L6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHFQ7M4L6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHFQ7M4L6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHFQ7M4L6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms