Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW05

PTCHD4, Patched domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCHD4Q6ZW05 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTCHD4Q6ZW05 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTCHD4Q6ZW05 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTCHD4Q6ZW05 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTCHD4Q6ZW05 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTCHD4Q6ZW05 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTCHD4Q6ZW05 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTCHD4Q6ZW05 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTCHD4Q6ZW05 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTCHD4Q6ZW05 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTCHD4Q6ZW05 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTCHD4Q6ZW05 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCHD4Q6ZW05 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCHD4Q6ZW05 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCHD4Q6ZW05 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCHD4Q6ZW05 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTCHD4Q6ZW05 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTCHD4Q6ZW05 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTCHD4Q6ZW05 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTCHD4Q6ZW05 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTCHD4Q6ZW05 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTCHD4Q6ZW05 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTCHD4Q6ZW05 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTCHD4Q6ZW05 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTCHD4Q6ZW05 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTCHD4Q6ZW05 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTCHD4Q6ZW05 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTCHD4Q6ZW05 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTCHD4Q6ZW05 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTCHD4Q6ZW05 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTCHD4Q6ZW05 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCHD4Q6ZW05 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTCHD4Q6ZW05 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTCHD4Q6ZW05 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTCHD4Q6ZW05 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTCHD4Q6ZW05 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTCHD4Q6ZW05 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTCHD4Q6ZW05 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTCHD4Q6ZW05 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTCHD4Q6ZW05 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTCHD4Q6ZW05 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTCHD4Q6ZW05 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTCHD4Q6ZW05 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTCHD4Q6ZW05 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTCHD4Q6ZW05 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTCHD4Q6ZW05 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTCHD4Q6ZW05 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTCHD4Q6ZW05 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTCHD4Q6ZW05 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTCHD4Q6ZW05 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTCHD4Q6ZW05 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTCHD4Q6ZW05 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTCHD4Q6ZW05 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTCHD4Q6ZW05 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTCHD4Q6ZW05 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTCHD4Q6ZW05 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTCHD4Q6ZW05 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTCHD4Q6ZW05 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTCHD4Q6ZW05 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTCHD4Q6ZW05 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTCHD4Q6ZW05 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCHD4Q6ZW05 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCHD4Q6ZW05 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTCHD4Q6ZW05 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTCHD4Q6ZW05 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTCHD4Q6ZW05 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTCHD4Q6ZW05 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms