Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRIG3Q6UXM1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRIG3Q6UXM1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRIG3Q6UXM1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRIG3Q6UXM1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRIG3Q6UXM1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRIG3Q6UXM1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRIG3Q6UXM1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRIG3Q6UXM1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRIG3Q6UXM1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRIG3Q6UXM1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRIG3Q6UXM1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRIG3Q6UXM1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRIG3Q6UXM1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRIG3Q6UXM1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRIG3Q6UXM1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRIG3Q6UXM1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRIG3Q6UXM1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRIG3Q6UXM1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRIG3Q6UXM1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRIG3Q6UXM1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRIG3Q6UXM1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRIG3Q6UXM1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRIG3Q6UXM1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRIG3Q6UXM1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRIG3Q6UXM1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRIG3Q6UXM1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRIG3Q6UXM1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRIG3Q6UXM1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRIG3Q6UXM1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRIG3Q6UXM1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRIG3Q6UXM1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRIG3Q6UXM1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRIG3Q6UXM1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRIG3Q6UXM1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRIG3Q6UXM1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRIG3Q6UXM1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRIG3Q6UXM1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRIG3Q6UXM1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRIG3Q6UXM1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRIG3Q6UXM1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRIG3Q6UXM1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRIG3Q6UXM1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRIG3Q6UXM1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRIG3Q6UXM1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRIG3Q6UXM1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRIG3Q6UXM1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRIG3Q6UXM1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRIG3Q6UXM1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRIG3Q6UXM1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRIG3Q6UXM1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRIG3Q6UXM1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRIG3Q6UXM1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LRIG3Q6UXM1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRIG3Q6UXM1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LRIG3Q6UXM1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRIG3Q6UXM1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRIG3Q6UXM1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRIG3Q6UXM1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRIG3Q6UXM1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRIG3Q6UXM1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRIG3Q6UXM1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRIG3Q6UXM1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRIG3Q6UXM1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRIG3Q6UXM1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRIG3Q6UXM1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRIG3Q6UXM1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRIG3Q6UXM1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRIG3Q6UXM1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRIG3Q6UXM1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRIG3Q6UXM1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRIG3Q6UXM1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LRIG3Q6UXM1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRIG3Q6UXM1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRIG3Q6UXM1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LRIG3Q6UXM1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRIG3Q6UXM1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRIG3Q6UXM1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRIG3Q6UXM1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LRIG3Q6UXM1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRIG3Q6UXM1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRIG3Q6UXM1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRIG3Q6UXM1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRIG3Q6UXM1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRIG3Q6UXM1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRIG3Q6UXM1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRIG3Q6UXM1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRIG3Q6UXM1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRIG3Q6UXM1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRIG3Q6UXM1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRIG3Q6UXM1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRIG3Q6UXM1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRIG3Q6UXM1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRIG3Q6UXM1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LRIG3Q6UXM1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRIG3Q6UXM1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRIG3Q6UXM1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.1 ms