Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CASC4Q6P4E1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CASC4Q6P4E1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CASC4Q6P4E1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CASC4Q6P4E1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CASC4Q6P4E1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CASC4Q6P4E1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASC4Q6P4E1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASC4Q6P4E1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CASC4Q6P4E1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASC4Q6P4E1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASC4Q6P4E1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASC4Q6P4E1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASC4Q6P4E1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASC4Q6P4E1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASC4Q6P4E1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASC4Q6P4E1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASC4Q6P4E1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASC4Q6P4E1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASC4Q6P4E1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASC4Q6P4E1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASC4Q6P4E1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASC4Q6P4E1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASC4Q6P4E1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASC4Q6P4E1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASC4Q6P4E1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASC4Q6P4E1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASC4Q6P4E1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASC4Q6P4E1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASC4Q6P4E1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASC4Q6P4E1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CASC4Q6P4E1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASC4Q6P4E1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASC4Q6P4E1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASC4Q6P4E1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASC4Q6P4E1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CASC4Q6P4E1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASC4Q6P4E1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASC4Q6P4E1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASC4Q6P4E1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASC4Q6P4E1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASC4Q6P4E1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASC4Q6P4E1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASC4Q6P4E1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASC4Q6P4E1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASC4Q6P4E1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASC4Q6P4E1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASC4Q6P4E1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASC4Q6P4E1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASC4Q6P4E1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASC4Q6P4E1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASC4Q6P4E1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASC4Q6P4E1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASC4Q6P4E1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASC4Q6P4E1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASC4Q6P4E1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASC4Q6P4E1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASC4Q6P4E1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASC4Q6P4E1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASC4Q6P4E1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASC4Q6P4E1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASC4Q6P4E1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASC4Q6P4E1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASC4Q6P4E1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASC4Q6P4E1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASC4Q6P4E1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASC4Q6P4E1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASC4Q6P4E1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASC4Q6P4E1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASC4Q6P4E1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASC4Q6P4E1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASC4Q6P4E1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASC4Q6P4E1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CASC4Q6P4E1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASC4Q6P4E1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CASC4Q6P4E1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASC4Q6P4E1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASC4Q6P4E1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASC4Q6P4E1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASC4Q6P4E1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASC4Q6P4E1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASC4Q6P4E1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASC4Q6P4E1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASC4Q6P4E1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASC4Q6P4E1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASC4Q6P4E1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CASC4Q6P4E1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CASC4Q6P4E1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASC4Q6P4E1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASC4Q6P4E1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASC4Q6P4E1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASC4Q6P4E1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASC4Q6P4E1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASC4Q6P4E1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASC4Q6P4E1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASC4Q6P4E1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASC4Q6P4E1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASC4Q6P4E1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASC4Q6P4E1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CASC4Q6P4E1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms