Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CAVIN1Q6NZI2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CAVIN1Q6NZI2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CAVIN1Q6NZI2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CAVIN1Q6NZI2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CAVIN1Q6NZI2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CAVIN1Q6NZI2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CAVIN1Q6NZI2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CAVIN1Q6NZI2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CAVIN1Q6NZI2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CAVIN1Q6NZI2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CAVIN1Q6NZI2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CAVIN1Q6NZI2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CAVIN1Q6NZI2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CAVIN1Q6NZI2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CAVIN1Q6NZI2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAVIN1Q6NZI2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAVIN1Q6NZI2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAVIN1Q6NZI2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CAVIN1Q6NZI2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CAVIN1Q6NZI2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CAVIN1Q6NZI2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CAVIN1Q6NZI2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CAVIN1Q6NZI2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CAVIN1Q6NZI2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAVIN1Q6NZI2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAVIN1Q6NZI2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAVIN1Q6NZI2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CAVIN1Q6NZI2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAVIN1Q6NZI2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAVIN1Q6NZI2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAVIN1Q6NZI2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CAVIN1Q6NZI2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CAVIN1Q6NZI2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CAVIN1Q6NZI2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CAVIN1Q6NZI2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CAVIN1Q6NZI2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CAVIN1Q6NZI2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CAVIN1Q6NZI2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CAVIN1Q6NZI2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CAVIN1Q6NZI2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CAVIN1Q6NZI2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CAVIN1Q6NZI2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CAVIN1Q6NZI2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CAVIN1Q6NZI2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAVIN1Q6NZI2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAVIN1Q6NZI2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAVIN1Q6NZI2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAVIN1Q6NZI2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAVIN1Q6NZI2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAVIN1Q6NZI2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAVIN1Q6NZI2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAVIN1Q6NZI2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAVIN1Q6NZI2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAVIN1Q6NZI2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAVIN1Q6NZI2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAVIN1Q6NZI2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAVIN1Q6NZI2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAVIN1Q6NZI2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAVIN1Q6NZI2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAVIN1Q6NZI2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAVIN1Q6NZI2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAVIN1Q6NZI2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAVIN1Q6NZI2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CAVIN1Q6NZI2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CAVIN1Q6NZI2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CAVIN1Q6NZI2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CAVIN1Q6NZI2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CAVIN1Q6NZI2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CAVIN1Q6NZI2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAVIN1Q6NZI2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAVIN1Q6NZI2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAVIN1Q6NZI2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAVIN1Q6NZI2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAVIN1Q6NZI2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CAVIN1Q6NZI2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CAVIN1Q6NZI2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CAVIN1Q6NZI2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CAVIN1Q6NZI2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CAVIN1Q6NZI2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAVIN1Q6NZI2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAVIN1Q6NZI2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CAVIN1Q6NZI2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAVIN1Q6NZI2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CAVIN1Q6NZI2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CAVIN1Q6NZI2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CAVIN1Q6NZI2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CAVIN1Q6NZI2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CAVIN1Q6NZI2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CAVIN1Q6NZI2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CAVIN1Q6NZI2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CAVIN1Q6NZI2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CAVIN1Q6NZI2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CAVIN1Q6NZI2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CAVIN1Q6NZI2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CAVIN1Q6NZI2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CAVIN1Q6NZI2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CAVIN1Q6NZI2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CAVIN1Q6NZI2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CAVIN1Q6NZI2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.8 ms