Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
VIRMAQ69YN4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.39■■■■□ 3.1
VIRMAQ69YN4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
VIRMAQ69YN4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
VIRMAQ69YN4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
VIRMAQ69YN4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
VIRMAQ69YN4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
VIRMAQ69YN4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
VIRMAQ69YN4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
VIRMAQ69YN4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
VIRMAQ69YN4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
VIRMAQ69YN4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
VIRMAQ69YN4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
VIRMAQ69YN4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
VIRMAQ69YN4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
VIRMAQ69YN4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
VIRMAQ69YN4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
VIRMAQ69YN4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
VIRMAQ69YN4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
VIRMAQ69YN4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
VIRMAQ69YN4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
VIRMAQ69YN4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
VIRMAQ69YN4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
VIRMAQ69YN4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
VIRMAQ69YN4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
VIRMAQ69YN4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
VIRMAQ69YN4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
VIRMAQ69YN4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
VIRMAQ69YN4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
VIRMAQ69YN4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
VIRMAQ69YN4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
VIRMAQ69YN4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
VIRMAQ69YN4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
VIRMAQ69YN4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
VIRMAQ69YN4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
VIRMAQ69YN4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
VIRMAQ69YN4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
VIRMAQ69YN4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
VIRMAQ69YN4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
VIRMAQ69YN4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
VIRMAQ69YN4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
VIRMAQ69YN4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
VIRMAQ69YN4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
VIRMAQ69YN4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
VIRMAQ69YN4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
VIRMAQ69YN4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
VIRMAQ69YN4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
VIRMAQ69YN4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
VIRMAQ69YN4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
VIRMAQ69YN4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
VIRMAQ69YN4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
VIRMAQ69YN4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
VIRMAQ69YN4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
VIRMAQ69YN4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
VIRMAQ69YN4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
VIRMAQ69YN4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
VIRMAQ69YN4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
VIRMAQ69YN4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
VIRMAQ69YN4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
VIRMAQ69YN4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
VIRMAQ69YN4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
VIRMAQ69YN4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
VIRMAQ69YN4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
VIRMAQ69YN4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
VIRMAQ69YN4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
VIRMAQ69YN4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
VIRMAQ69YN4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
VIRMAQ69YN4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
VIRMAQ69YN4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
VIRMAQ69YN4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
VIRMAQ69YN4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
VIRMAQ69YN4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
VIRMAQ69YN4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
VIRMAQ69YN4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
VIRMAQ69YN4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
VIRMAQ69YN4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
VIRMAQ69YN4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
VIRMAQ69YN4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
VIRMAQ69YN4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
VIRMAQ69YN4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
VIRMAQ69YN4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
VIRMAQ69YN4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
VIRMAQ69YN4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
VIRMAQ69YN4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
VIRMAQ69YN4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
VIRMAQ69YN4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
VIRMAQ69YN4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
VIRMAQ69YN4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
VIRMAQ69YN4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
VIRMAQ69YN4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
VIRMAQ69YN4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
VIRMAQ69YN4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
VIRMAQ69YN4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
VIRMAQ69YN4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
VIRMAQ69YN4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
VIRMAQ69YN4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
VIRMAQ69YN4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
VIRMAQ69YN4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
VIRMAQ69YN4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
VIRMAQ69YN4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms