Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCTD16Q68DU8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCTD16Q68DU8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCTD16Q68DU8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCTD16Q68DU8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCTD16Q68DU8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCTD16Q68DU8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCTD16Q68DU8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCTD16Q68DU8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCTD16Q68DU8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCTD16Q68DU8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
KCTD16Q68DU8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCTD16Q68DU8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCTD16Q68DU8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
KCTD16Q68DU8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCTD16Q68DU8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCTD16Q68DU8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
KCTD16Q68DU8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCTD16Q68DU8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCTD16Q68DU8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCTD16Q68DU8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCTD16Q68DU8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCTD16Q68DU8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCTD16Q68DU8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KCTD16Q68DU8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCTD16Q68DU8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCTD16Q68DU8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCTD16Q68DU8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCTD16Q68DU8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCTD16Q68DU8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCTD16Q68DU8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCTD16Q68DU8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCTD16Q68DU8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KCTD16Q68DU8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KCTD16Q68DU8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KCTD16Q68DU8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCTD16Q68DU8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCTD16Q68DU8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCTD16Q68DU8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCTD16Q68DU8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCTD16Q68DU8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCTD16Q68DU8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCTD16Q68DU8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCTD16Q68DU8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCTD16Q68DU8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCTD16Q68DU8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCTD16Q68DU8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCTD16Q68DU8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCTD16Q68DU8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCTD16Q68DU8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCTD16Q68DU8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCTD16Q68DU8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCTD16Q68DU8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCTD16Q68DU8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCTD16Q68DU8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCTD16Q68DU8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCTD16Q68DU8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KCTD16Q68DU8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCTD16Q68DU8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCTD16Q68DU8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCTD16Q68DU8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCTD16Q68DU8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCTD16Q68DU8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCTD16Q68DU8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCTD16Q68DU8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCTD16Q68DU8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCTD16Q68DU8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCTD16Q68DU8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCTD16Q68DU8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCTD16Q68DU8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCTD16Q68DU8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCTD16Q68DU8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCTD16Q68DU8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCTD16Q68DU8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCTD16Q68DU8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCTD16Q68DU8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCTD16Q68DU8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCTD16Q68DU8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCTD16Q68DU8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCTD16Q68DU8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCTD16Q68DU8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCTD16Q68DU8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCTD16Q68DU8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCTD16Q68DU8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCTD16Q68DU8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCTD16Q68DU8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCTD16Q68DU8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCTD16Q68DU8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCTD16Q68DU8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCTD16Q68DU8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCTD16Q68DU8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCTD16Q68DU8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KCTD16Q68DU8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
KCTD16Q68DU8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KCTD16Q68DU8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCTD16Q68DU8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
KCTD16Q68DU8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCTD16Q68DU8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCTD16Q68DU8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCTD16Q68DU8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 675 ms