Protein–RNA interactions for Protein: Q5ZPR3

CD276, CD276 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD276Q5ZPR3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD276Q5ZPR3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD276Q5ZPR3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD276Q5ZPR3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD276Q5ZPR3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD276Q5ZPR3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD276Q5ZPR3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD276Q5ZPR3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD276Q5ZPR3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD276Q5ZPR3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD276Q5ZPR3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD276Q5ZPR3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD276Q5ZPR3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD276Q5ZPR3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD276Q5ZPR3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD276Q5ZPR3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD276Q5ZPR3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD276Q5ZPR3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD276Q5ZPR3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD276Q5ZPR3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD276Q5ZPR3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD276Q5ZPR3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD276Q5ZPR3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD276Q5ZPR3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD276Q5ZPR3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD276Q5ZPR3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD276Q5ZPR3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD276Q5ZPR3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD276Q5ZPR3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD276Q5ZPR3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD276Q5ZPR3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD276Q5ZPR3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD276Q5ZPR3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD276Q5ZPR3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD276Q5ZPR3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD276Q5ZPR3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD276Q5ZPR3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CD276Q5ZPR3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD276Q5ZPR3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CD276Q5ZPR3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD276Q5ZPR3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD276Q5ZPR3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD276Q5ZPR3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD276Q5ZPR3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD276Q5ZPR3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD276Q5ZPR3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD276Q5ZPR3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD276Q5ZPR3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD276Q5ZPR3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD276Q5ZPR3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD276Q5ZPR3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD276Q5ZPR3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD276Q5ZPR3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CD276Q5ZPR3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD276Q5ZPR3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD276Q5ZPR3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD276Q5ZPR3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD276Q5ZPR3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD276Q5ZPR3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD276Q5ZPR3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD276Q5ZPR3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD276Q5ZPR3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD276Q5ZPR3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD276Q5ZPR3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD276Q5ZPR3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CD276Q5ZPR3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CD276Q5ZPR3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD276Q5ZPR3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD276Q5ZPR3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD276Q5ZPR3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD276Q5ZPR3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD276Q5ZPR3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD276Q5ZPR3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD276Q5ZPR3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD276Q5ZPR3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD276Q5ZPR3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD276Q5ZPR3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD276Q5ZPR3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD276Q5ZPR3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD276Q5ZPR3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD276Q5ZPR3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD276Q5ZPR3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CD276Q5ZPR3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD276Q5ZPR3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD276Q5ZPR3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD276Q5ZPR3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD276Q5ZPR3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD276Q5ZPR3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD276Q5ZPR3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD276Q5ZPR3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD276Q5ZPR3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD276Q5ZPR3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD276Q5ZPR3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD276Q5ZPR3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD276Q5ZPR3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD276Q5ZPR3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CD276Q5ZPR3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD276Q5ZPR3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD276Q5ZPR3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD276Q5ZPR3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms