Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPATA1Q5VX52 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPATA1Q5VX52 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPATA1Q5VX52 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SPATA1Q5VX52 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SPATA1Q5VX52 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPATA1Q5VX52 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPATA1Q5VX52 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPATA1Q5VX52 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPATA1Q5VX52 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPATA1Q5VX52 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPATA1Q5VX52 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPATA1Q5VX52 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPATA1Q5VX52 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPATA1Q5VX52 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPATA1Q5VX52 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPATA1Q5VX52 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPATA1Q5VX52 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPATA1Q5VX52 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPATA1Q5VX52 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPATA1Q5VX52 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
SPATA1Q5VX52 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SPATA1Q5VX52 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPATA1Q5VX52 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPATA1Q5VX52 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPATA1Q5VX52 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPATA1Q5VX52 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPATA1Q5VX52 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPATA1Q5VX52 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPATA1Q5VX52 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPATA1Q5VX52 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPATA1Q5VX52 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPATA1Q5VX52 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPATA1Q5VX52 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPATA1Q5VX52 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPATA1Q5VX52 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPATA1Q5VX52 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPATA1Q5VX52 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPATA1Q5VX52 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPATA1Q5VX52 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPATA1Q5VX52 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPATA1Q5VX52 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPATA1Q5VX52 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPATA1Q5VX52 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPATA1Q5VX52 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPATA1Q5VX52 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPATA1Q5VX52 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPATA1Q5VX52 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPATA1Q5VX52 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SPATA1Q5VX52 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPATA1Q5VX52 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPATA1Q5VX52 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPATA1Q5VX52 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPATA1Q5VX52 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPATA1Q5VX52 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPATA1Q5VX52 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPATA1Q5VX52 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPATA1Q5VX52 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPATA1Q5VX52 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPATA1Q5VX52 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPATA1Q5VX52 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPATA1Q5VX52 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPATA1Q5VX52 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPATA1Q5VX52 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPATA1Q5VX52 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPATA1Q5VX52 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPATA1Q5VX52 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPATA1Q5VX52 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPATA1Q5VX52 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPATA1Q5VX52 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPATA1Q5VX52 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPATA1Q5VX52 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SPATA1Q5VX52 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPATA1Q5VX52 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPATA1Q5VX52 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPATA1Q5VX52 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPATA1Q5VX52 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPATA1Q5VX52 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPATA1Q5VX52 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPATA1Q5VX52 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPATA1Q5VX52 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPATA1Q5VX52 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPATA1Q5VX52 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPATA1Q5VX52 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPATA1Q5VX52 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPATA1Q5VX52 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPATA1Q5VX52 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPATA1Q5VX52 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPATA1Q5VX52 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPATA1Q5VX52 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPATA1Q5VX52 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPATA1Q5VX52 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPATA1Q5VX52 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPATA1Q5VX52 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPATA1Q5VX52 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPATA1Q5VX52 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SPATA1Q5VX52 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPATA1Q5VX52 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPATA1Q5VX52 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPATA1Q5VX52 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms