Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATAD3BQ5T9A4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATAD3BQ5T9A4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATAD3BQ5T9A4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATAD3BQ5T9A4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATAD3BQ5T9A4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATAD3BQ5T9A4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATAD3BQ5T9A4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATAD3BQ5T9A4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATAD3BQ5T9A4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD3BQ5T9A4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD3BQ5T9A4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD3BQ5T9A4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD3BQ5T9A4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD3BQ5T9A4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD3BQ5T9A4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD3BQ5T9A4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD3BQ5T9A4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD3BQ5T9A4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD3BQ5T9A4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD3BQ5T9A4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD3BQ5T9A4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD3BQ5T9A4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD3BQ5T9A4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD3BQ5T9A4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD3BQ5T9A4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD3BQ5T9A4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD3BQ5T9A4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD3BQ5T9A4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAD3BQ5T9A4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAD3BQ5T9A4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAD3BQ5T9A4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAD3BQ5T9A4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATAD3BQ5T9A4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATAD3BQ5T9A4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATAD3BQ5T9A4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATAD3BQ5T9A4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATAD3BQ5T9A4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATAD3BQ5T9A4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATAD3BQ5T9A4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATAD3BQ5T9A4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATAD3BQ5T9A4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATAD3BQ5T9A4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATAD3BQ5T9A4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATAD3BQ5T9A4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATAD3BQ5T9A4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATAD3BQ5T9A4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATAD3BQ5T9A4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATAD3BQ5T9A4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATAD3BQ5T9A4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATAD3BQ5T9A4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATAD3BQ5T9A4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATAD3BQ5T9A4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAD3BQ5T9A4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAD3BQ5T9A4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAD3BQ5T9A4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAD3BQ5T9A4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAD3BQ5T9A4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATAD3BQ5T9A4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATAD3BQ5T9A4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATAD3BQ5T9A4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATAD3BQ5T9A4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ATAD3BQ5T9A4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATAD3BQ5T9A4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATAD3BQ5T9A4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATAD3BQ5T9A4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATAD3BQ5T9A4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATAD3BQ5T9A4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAD3BQ5T9A4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAD3BQ5T9A4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAD3BQ5T9A4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAD3BQ5T9A4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATAD3BQ5T9A4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATAD3BQ5T9A4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATAD3BQ5T9A4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATAD3BQ5T9A4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATAD3BQ5T9A4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATAD3BQ5T9A4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATAD3BQ5T9A4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATAD3BQ5T9A4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATAD3BQ5T9A4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATAD3BQ5T9A4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATAD3BQ5T9A4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATAD3BQ5T9A4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAD3BQ5T9A4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAD3BQ5T9A4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAD3BQ5T9A4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAD3BQ5T9A4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAD3BQ5T9A4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAD3BQ5T9A4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAD3BQ5T9A4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATAD3BQ5T9A4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATAD3BQ5T9A4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATAD3BQ5T9A4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATAD3BQ5T9A4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATAD3BQ5T9A4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATAD3BQ5T9A4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATAD3BQ5T9A4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATAD3BQ5T9A4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATAD3BQ5T9A4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms