Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0T1

Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SCART1, humanhuman

Predictions only

Length 1,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q4G0T1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Q4G0T1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Q4G0T1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Q4G0T1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Q4G0T1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Q4G0T1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Q4G0T1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Q4G0T1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Q4G0T1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Q4G0T1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Q4G0T1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Q4G0T1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Q4G0T1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Q4G0T1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Q4G0T1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Q4G0T1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Q4G0T1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Q4G0T1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Q4G0T1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Q4G0T1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Q4G0T1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Q4G0T1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Q4G0T1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Q4G0T1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Q4G0T1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Q4G0T1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Q4G0T1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Q4G0T1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q4G0T1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q4G0T1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q4G0T1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q4G0T1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q4G0T1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Q4G0T1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Q4G0T1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Q4G0T1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Q4G0T1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Q4G0T1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Q4G0T1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Q4G0T1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Q4G0T1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Q4G0T1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Q4G0T1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Q4G0T1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Q4G0T1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Q4G0T1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Q4G0T1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Q4G0T1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Q4G0T1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Q4G0T1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Q4G0T1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Q4G0T1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Q4G0T1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Q4G0T1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Q4G0T1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Q4G0T1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Q4G0T1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Q4G0T1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Q4G0T1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Q4G0T1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Q4G0T1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Q4G0T1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Q4G0T1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Q4G0T1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Q4G0T1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Q4G0T1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Q4G0T1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Q4G0T1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Q4G0T1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Q4G0T1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Q4G0T1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Q4G0T1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Q4G0T1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Q4G0T1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Q4G0T1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Q4G0T1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Q4G0T1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Q4G0T1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Q4G0T1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Q4G0T1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Q4G0T1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Q4G0T1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Q4G0T1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Q4G0T1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Q4G0T1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Q4G0T1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Q4G0T1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Q4G0T1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Q4G0T1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Q4G0T1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Q4G0T1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Q4G0T1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Q4G0T1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Q4G0T1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Q4G0T1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Q4G0T1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Q4G0T1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Q4G0T1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Q4G0T1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Q4G0T1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms