Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0T1

Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SCART1, humanhuman

Predictions only

Length 1,027 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q4G0T1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Q4G0T1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Q4G0T1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Q4G0T1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Q4G0T1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Q4G0T1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Q4G0T1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Q4G0T1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Q4G0T1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Q4G0T1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Q4G0T1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Q4G0T1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Q4G0T1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Q4G0T1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Q4G0T1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Q4G0T1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Q4G0T1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Q4G0T1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Q4G0T1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Q4G0T1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Q4G0T1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Q4G0T1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Q4G0T1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Q4G0T1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Q4G0T1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Q4G0T1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Q4G0T1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Q4G0T1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q4G0T1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q4G0T1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q4G0T1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q4G0T1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q4G0T1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Q4G0T1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Q4G0T1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Q4G0T1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Q4G0T1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Q4G0T1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Q4G0T1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Q4G0T1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Q4G0T1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Q4G0T1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Q4G0T1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Q4G0T1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Q4G0T1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Q4G0T1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Q4G0T1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Q4G0T1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Q4G0T1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Q4G0T1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Q4G0T1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Q4G0T1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Q4G0T1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Q4G0T1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Q4G0T1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Q4G0T1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Q4G0T1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Q4G0T1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Q4G0T1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Q4G0T1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Q4G0T1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Q4G0T1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Q4G0T1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Q4G0T1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Q4G0T1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Q4G0T1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Q4G0T1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Q4G0T1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Q4G0T1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Q4G0T1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Q4G0T1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Q4G0T1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Q4G0T1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Q4G0T1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Q4G0T1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Q4G0T1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Q4G0T1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Q4G0T1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Q4G0T1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Q4G0T1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Q4G0T1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Q4G0T1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Q4G0T1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Q4G0T1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Q4G0T1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Q4G0T1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Q4G0T1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Q4G0T1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Q4G0T1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Q4G0T1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Q4G0T1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Q4G0T1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Q4G0T1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Q4G0T1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Q4G0T1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Q4G0T1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Q4G0T1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Q4G0T1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Q4G0T1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Q4G0T1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms