Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0N7

FAM229B, Protein FAM229B, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM229BQ4G0N7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM229BQ4G0N7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM229BQ4G0N7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM229BQ4G0N7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM229BQ4G0N7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms