Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMAD1Q15797 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMAD1Q15797 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMAD1Q15797 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMAD1Q15797 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMAD1Q15797 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMAD1Q15797 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMAD1Q15797 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMAD1Q15797 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMAD1Q15797 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMAD1Q15797 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMAD1Q15797 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMAD1Q15797 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMAD1Q15797 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMAD1Q15797 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMAD1Q15797 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMAD1Q15797 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMAD1Q15797 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMAD1Q15797 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMAD1Q15797 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMAD1Q15797 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMAD1Q15797 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMAD1Q15797 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SMAD1Q15797 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMAD1Q15797 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMAD1Q15797 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMAD1Q15797 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMAD1Q15797 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMAD1Q15797 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMAD1Q15797 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMAD1Q15797 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SMAD1Q15797 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMAD1Q15797 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMAD1Q15797 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMAD1Q15797 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMAD1Q15797 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMAD1Q15797 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMAD1Q15797 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMAD1Q15797 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMAD1Q15797 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMAD1Q15797 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMAD1Q15797 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SMAD1Q15797 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMAD1Q15797 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMAD1Q15797 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMAD1Q15797 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMAD1Q15797 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMAD1Q15797 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMAD1Q15797 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMAD1Q15797 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMAD1Q15797 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMAD1Q15797 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMAD1Q15797 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMAD1Q15797 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMAD1Q15797 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMAD1Q15797 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMAD1Q15797 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SMAD1Q15797 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMAD1Q15797 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMAD1Q15797 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SMAD1Q15797 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMAD1Q15797 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMAD1Q15797 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMAD1Q15797 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMAD1Q15797 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMAD1Q15797 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SMAD1Q15797 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMAD1Q15797 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMAD1Q15797 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMAD1Q15797 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMAD1Q15797 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMAD1Q15797 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMAD1Q15797 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMAD1Q15797 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMAD1Q15797 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMAD1Q15797 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMAD1Q15797 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMAD1Q15797 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMAD1Q15797 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMAD1Q15797 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMAD1Q15797 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMAD1Q15797 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMAD1Q15797 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMAD1Q15797 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMAD1Q15797 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMAD1Q15797 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMAD1Q15797 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMAD1Q15797 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMAD1Q15797 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMAD1Q15797 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMAD1Q15797 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMAD1Q15797 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMAD1Q15797 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SMAD1Q15797 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMAD1Q15797 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMAD1Q15797 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMAD1Q15797 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMAD1Q15797 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMAD1Q15797 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMAD1Q15797 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms