Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYTH1Q15438 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYTH1Q15438 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYTH1Q15438 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYTH1Q15438 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYTH1Q15438 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYTH1Q15438 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYTH1Q15438 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYTH1Q15438 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYTH1Q15438 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CYTH1Q15438 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYTH1Q15438 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CYTH1Q15438 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CYTH1Q15438 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYTH1Q15438 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYTH1Q15438 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYTH1Q15438 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYTH1Q15438 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYTH1Q15438 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYTH1Q15438 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYTH1Q15438 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYTH1Q15438 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYTH1Q15438 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYTH1Q15438 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYTH1Q15438 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYTH1Q15438 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYTH1Q15438 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYTH1Q15438 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYTH1Q15438 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYTH1Q15438 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYTH1Q15438 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYTH1Q15438 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYTH1Q15438 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYTH1Q15438 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYTH1Q15438 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CYTH1Q15438 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CYTH1Q15438 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYTH1Q15438 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYTH1Q15438 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CYTH1Q15438 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYTH1Q15438 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYTH1Q15438 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYTH1Q15438 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYTH1Q15438 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYTH1Q15438 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYTH1Q15438 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYTH1Q15438 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYTH1Q15438 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYTH1Q15438 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYTH1Q15438 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYTH1Q15438 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYTH1Q15438 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYTH1Q15438 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYTH1Q15438 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYTH1Q15438 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYTH1Q15438 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYTH1Q15438 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYTH1Q15438 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYTH1Q15438 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYTH1Q15438 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CYTH1Q15438 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYTH1Q15438 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYTH1Q15438 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYTH1Q15438 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYTH1Q15438 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYTH1Q15438 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYTH1Q15438 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYTH1Q15438 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYTH1Q15438 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYTH1Q15438 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYTH1Q15438 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYTH1Q15438 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYTH1Q15438 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYTH1Q15438 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYTH1Q15438 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CYTH1Q15438 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYTH1Q15438 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYTH1Q15438 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYTH1Q15438 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYTH1Q15438 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYTH1Q15438 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYTH1Q15438 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYTH1Q15438 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYTH1Q15438 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYTH1Q15438 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYTH1Q15438 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYTH1Q15438 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYTH1Q15438 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CYTH1Q15438 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYTH1Q15438 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYTH1Q15438 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYTH1Q15438 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYTH1Q15438 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYTH1Q15438 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYTH1Q15438 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CYTH1Q15438 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYTH1Q15438 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CYTH1Q15438 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYTH1Q15438 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYTH1Q15438 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms