Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLR1Q15399 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLR1Q15399 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR1Q15399 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR1Q15399 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR1Q15399 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR1Q15399 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR1Q15399 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLR1Q15399 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TLR1Q15399 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLR1Q15399 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLR1Q15399 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TLR1Q15399 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TLR1Q15399 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLR1Q15399 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLR1Q15399 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TLR1Q15399 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TLR1Q15399 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TLR1Q15399 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLR1Q15399 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLR1Q15399 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLR1Q15399 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TLR1Q15399 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLR1Q15399 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR1Q15399 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR1Q15399 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR1Q15399 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR1Q15399 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR1Q15399 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR1Q15399 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR1Q15399 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLR1Q15399 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLR1Q15399 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLR1Q15399 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLR1Q15399 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLR1Q15399 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLR1Q15399 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLR1Q15399 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLR1Q15399 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TLR1Q15399 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TLR1Q15399 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TLR1Q15399 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TLR1Q15399 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLR1Q15399 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLR1Q15399 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLR1Q15399 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TLR1Q15399 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLR1Q15399 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR1Q15399 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR1Q15399 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR1Q15399 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR1Q15399 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR1Q15399 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLR1Q15399 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLR1Q15399 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLR1Q15399 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TLR1Q15399 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TLR1Q15399 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TLR1Q15399 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TLR1Q15399 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TLR1Q15399 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLR1Q15399 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLR1Q15399 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TLR1Q15399 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLR1Q15399 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLR1Q15399 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLR1Q15399 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TLR1Q15399 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TLR1Q15399 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TLR1Q15399 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TLR1Q15399 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TLR1Q15399 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TLR1Q15399 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TLR1Q15399 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TLR1Q15399 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TLR1Q15399 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TLR1Q15399 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLR1Q15399 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLR1Q15399 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLR1Q15399 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLR1Q15399 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TLR1Q15399 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TLR1Q15399 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TLR1Q15399 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLR1Q15399 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLR1Q15399 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLR1Q15399 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLR1Q15399 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLR1Q15399 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLR1Q15399 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLR1Q15399 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLR1Q15399 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLR1Q15399 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLR1Q15399 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TLR1Q15399 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TLR1Q15399 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TLR1Q15399 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TLR1Q15399 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TLR1Q15399 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TLR1Q15399 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
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