Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCM1Q15154 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCM1Q15154 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCM1Q15154 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCM1Q15154 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCM1Q15154 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCM1Q15154 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCM1Q15154 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCM1Q15154 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCM1Q15154 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCM1Q15154 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCM1Q15154 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCM1Q15154 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCM1Q15154 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCM1Q15154 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCM1Q15154 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCM1Q15154 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCM1Q15154 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCM1Q15154 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCM1Q15154 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCM1Q15154 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PCM1Q15154 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCM1Q15154 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCM1Q15154 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCM1Q15154 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCM1Q15154 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCM1Q15154 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCM1Q15154 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCM1Q15154 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCM1Q15154 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCM1Q15154 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCM1Q15154 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCM1Q15154 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCM1Q15154 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCM1Q15154 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCM1Q15154 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PCM1Q15154 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCM1Q15154 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCM1Q15154 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCM1Q15154 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCM1Q15154 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCM1Q15154 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCM1Q15154 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCM1Q15154 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCM1Q15154 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCM1Q15154 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCM1Q15154 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCM1Q15154 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCM1Q15154 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCM1Q15154 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCM1Q15154 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCM1Q15154 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCM1Q15154 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCM1Q15154 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCM1Q15154 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCM1Q15154 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCM1Q15154 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCM1Q15154 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PCM1Q15154 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PCM1Q15154 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCM1Q15154 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCM1Q15154 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCM1Q15154 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCM1Q15154 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PCM1Q15154 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCM1Q15154 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCM1Q15154 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCM1Q15154 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCM1Q15154 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCM1Q15154 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCM1Q15154 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCM1Q15154 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCM1Q15154 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCM1Q15154 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCM1Q15154 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCM1Q15154 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCM1Q15154 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCM1Q15154 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCM1Q15154 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCM1Q15154 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PCM1Q15154 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PCM1Q15154 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCM1Q15154 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PCM1Q15154 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCM1Q15154 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCM1Q15154 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCM1Q15154 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCM1Q15154 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCM1Q15154 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCM1Q15154 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCM1Q15154 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCM1Q15154 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCM1Q15154 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCM1Q15154 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCM1Q15154 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCM1Q15154 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCM1Q15154 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCM1Q15154 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCM1Q15154 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCM1Q15154 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms