Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCAPHQ15003 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCAPHQ15003 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCAPHQ15003 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCAPHQ15003 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCAPHQ15003 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCAPHQ15003 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCAPHQ15003 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCAPHQ15003 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCAPHQ15003 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCAPHQ15003 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCAPHQ15003 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCAPHQ15003 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCAPHQ15003 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCAPHQ15003 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCAPHQ15003 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCAPHQ15003 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCAPHQ15003 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NCAPHQ15003 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NCAPHQ15003 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NCAPHQ15003 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NCAPHQ15003 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCAPHQ15003 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCAPHQ15003 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCAPHQ15003 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCAPHQ15003 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCAPHQ15003 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCAPHQ15003 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCAPHQ15003 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCAPHQ15003 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCAPHQ15003 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCAPHQ15003 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCAPHQ15003 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCAPHQ15003 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NCAPHQ15003 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCAPHQ15003 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCAPHQ15003 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCAPHQ15003 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCAPHQ15003 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCAPHQ15003 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCAPHQ15003 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCAPHQ15003 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCAPHQ15003 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NCAPHQ15003 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCAPHQ15003 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCAPHQ15003 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCAPHQ15003 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NCAPHQ15003 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NCAPHQ15003 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCAPHQ15003 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCAPHQ15003 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCAPHQ15003 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCAPHQ15003 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCAPHQ15003 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCAPHQ15003 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCAPHQ15003 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCAPHQ15003 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCAPHQ15003 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCAPHQ15003 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCAPHQ15003 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCAPHQ15003 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCAPHQ15003 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCAPHQ15003 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCAPHQ15003 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCAPHQ15003 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCAPHQ15003 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCAPHQ15003 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCAPHQ15003 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NCAPHQ15003 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NCAPHQ15003 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCAPHQ15003 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCAPHQ15003 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCAPHQ15003 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCAPHQ15003 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCAPHQ15003 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCAPHQ15003 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCAPHQ15003 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCAPHQ15003 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCAPHQ15003 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCAPHQ15003 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCAPHQ15003 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCAPHQ15003 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCAPHQ15003 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCAPHQ15003 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NCAPHQ15003 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCAPHQ15003 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCAPHQ15003 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCAPHQ15003 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCAPHQ15003 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCAPHQ15003 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCAPHQ15003 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCAPHQ15003 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCAPHQ15003 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCAPHQ15003 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NCAPHQ15003 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCAPHQ15003 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCAPHQ15003 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCAPHQ15003 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCAPHQ15003 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCAPHQ15003 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
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