Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CIRBPQ14011 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CIRBPQ14011 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CIRBPQ14011 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIRBPQ14011 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIRBPQ14011 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIRBPQ14011 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIRBPQ14011 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIRBPQ14011 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CIRBPQ14011 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIRBPQ14011 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIRBPQ14011 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIRBPQ14011 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIRBPQ14011 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CIRBPQ14011 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CIRBPQ14011 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIRBPQ14011 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIRBPQ14011 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CIRBPQ14011 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIRBPQ14011 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CIRBPQ14011 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIRBPQ14011 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CIRBPQ14011 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CIRBPQ14011 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIRBPQ14011 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CIRBPQ14011 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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