Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP1A4Q13733 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP1A4Q13733 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP1A4Q13733 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP1A4Q13733 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP1A4Q13733 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP1A4Q13733 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A4Q13733 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A4Q13733 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A4Q13733 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A4Q13733 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A4Q13733 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A4Q13733 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A4Q13733 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A4Q13733 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A4Q13733 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A4Q13733 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A4Q13733 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A4Q13733 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A4Q13733 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1A4Q13733 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1A4Q13733 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1A4Q13733 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A4Q13733 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A4Q13733 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP1A4Q13733 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP1A4Q13733 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP1A4Q13733 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1A4Q13733 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1A4Q13733 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1A4Q13733 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1A4Q13733 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1A4Q13733 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP1A4Q13733 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP1A4Q13733 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP1A4Q13733 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP1A4Q13733 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP1A4Q13733 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP1A4Q13733 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP1A4Q13733 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP1A4Q13733 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP1A4Q13733 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP1A4Q13733 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP1A4Q13733 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP1A4Q13733 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP1A4Q13733 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP1A4Q13733 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP1A4Q13733 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP1A4Q13733 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP1A4Q13733 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP1A4Q13733 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP1A4Q13733 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP1A4Q13733 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP1A4Q13733 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP1A4Q13733 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP1A4Q13733 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP1A4Q13733 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP1A4Q13733 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP1A4Q13733 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP1A4Q13733 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP1A4Q13733 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP1A4Q13733 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP1A4Q13733 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP1A4Q13733 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP1A4Q13733 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP1A4Q13733 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP1A4Q13733 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP1A4Q13733 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
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