Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHAF1BQ13112 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHAF1BQ13112 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHAF1BQ13112 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHAF1BQ13112 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHAF1BQ13112 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHAF1BQ13112 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHAF1BQ13112 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHAF1BQ13112 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAF1BQ13112 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAF1BQ13112 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAF1BQ13112 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAF1BQ13112 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAF1BQ13112 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHAF1BQ13112 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAF1BQ13112 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAF1BQ13112 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAF1BQ13112 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAF1BQ13112 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAF1BQ13112 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAF1BQ13112 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAF1BQ13112 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAF1BQ13112 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAF1BQ13112 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAF1BQ13112 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAF1BQ13112 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAF1BQ13112 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAF1BQ13112 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAF1BQ13112 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAF1BQ13112 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAF1BQ13112 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAF1BQ13112 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAF1BQ13112 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAF1BQ13112 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAF1BQ13112 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAF1BQ13112 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAF1BQ13112 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAF1BQ13112 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAF1BQ13112 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAF1BQ13112 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAF1BQ13112 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAF1BQ13112 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAF1BQ13112 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAF1BQ13112 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAF1BQ13112 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAF1BQ13112 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAF1BQ13112 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAF1BQ13112 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAF1BQ13112 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHAF1BQ13112 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHAF1BQ13112 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHAF1BQ13112 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHAF1BQ13112 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHAF1BQ13112 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHAF1BQ13112 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHAF1BQ13112 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHAF1BQ13112 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHAF1BQ13112 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHAF1BQ13112 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CHAF1BQ13112 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAF1BQ13112 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAF1BQ13112 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAF1BQ13112 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAF1BQ13112 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAF1BQ13112 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAF1BQ13112 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAF1BQ13112 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAF1BQ13112 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAF1BQ13112 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAF1BQ13112 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAF1BQ13112 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAF1BQ13112 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAF1BQ13112 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAF1BQ13112 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAF1BQ13112 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAF1BQ13112 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAF1BQ13112 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1BQ13112 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1BQ13112 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1BQ13112 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1BQ13112 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAF1BQ13112 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHAF1BQ13112 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHAF1BQ13112 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHAF1BQ13112 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHAF1BQ13112 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHAF1BQ13112 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAF1BQ13112 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAF1BQ13112 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAF1BQ13112 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAF1BQ13112 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAF1BQ13112 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAF1BQ13112 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAF1BQ13112 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAF1BQ13112 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAF1BQ13112 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAF1BQ13112 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAF1BQ13112 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAF1BQ13112 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAF1BQ13112 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
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