Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DHX9Q08211 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DHX9Q08211 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DHX9Q08211 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DHX9Q08211 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DHX9Q08211 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DHX9Q08211 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DHX9Q08211 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DHX9Q08211 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DHX9Q08211 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DHX9Q08211 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DHX9Q08211 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DHX9Q08211 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DHX9Q08211 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DHX9Q08211 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DHX9Q08211 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DHX9Q08211 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DHX9Q08211 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DHX9Q08211 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DHX9Q08211 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DHX9Q08211 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DHX9Q08211 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DHX9Q08211 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DHX9Q08211 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DHX9Q08211 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DHX9Q08211 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DHX9Q08211 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DHX9Q08211 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DHX9Q08211 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DHX9Q08211 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
DHX9Q08211 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DHX9Q08211 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DHX9Q08211 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DHX9Q08211 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DHX9Q08211 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DHX9Q08211 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DHX9Q08211 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
DHX9Q08211 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DHX9Q08211 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DHX9Q08211 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DHX9Q08211 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DHX9Q08211 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DHX9Q08211 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DHX9Q08211 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DHX9Q08211 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DHX9Q08211 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DHX9Q08211 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DHX9Q08211 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DHX9Q08211 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DHX9Q08211 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DHX9Q08211 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DHX9Q08211 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DHX9Q08211 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DHX9Q08211 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DHX9Q08211 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DHX9Q08211 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DHX9Q08211 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DHX9Q08211 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DHX9Q08211 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DHX9Q08211 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DHX9Q08211 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DHX9Q08211 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
DHX9Q08211 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DHX9Q08211 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DHX9Q08211 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DHX9Q08211 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DHX9Q08211 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DHX9Q08211 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DHX9Q08211 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DHX9Q08211 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DHX9Q08211 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DHX9Q08211 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DHX9Q08211 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DHX9Q08211 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DHX9Q08211 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DHX9Q08211 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DHX9Q08211 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DHX9Q08211 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DHX9Q08211 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
DHX9Q08211 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DHX9Q08211 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DHX9Q08211 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DHX9Q08211 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DHX9Q08211 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DHX9Q08211 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DHX9Q08211 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DHX9Q08211 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DHX9Q08211 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
DHX9Q08211 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DHX9Q08211 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DHX9Q08211 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DHX9Q08211 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DHX9Q08211 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DHX9Q08211 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DHX9Q08211 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DHX9Q08211 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DHX9Q08211 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DHX9Q08211 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DHX9Q08211 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DHX9Q08211 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms