Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GCNT1Q02742 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GCNT1Q02742 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GCNT1Q02742 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GCNT1Q02742 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GCNT1Q02742 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GCNT1Q02742 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GCNT1Q02742 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GCNT1Q02742 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GCNT1Q02742 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GCNT1Q02742 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GCNT1Q02742 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GCNT1Q02742 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GCNT1Q02742 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCNT1Q02742 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCNT1Q02742 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GCNT1Q02742 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GCNT1Q02742 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GCNT1Q02742 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCNT1Q02742 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GCNT1Q02742 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCNT1Q02742 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCNT1Q02742 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCNT1Q02742 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCNT1Q02742 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GCNT1Q02742 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCNT1Q02742 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GCNT1Q02742 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GCNT1Q02742 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GCNT1Q02742 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GCNT1Q02742 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GCNT1Q02742 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GCNT1Q02742 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCNT1Q02742 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCNT1Q02742 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GCNT1Q02742 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCNT1Q02742 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GCNT1Q02742 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GCNT1Q02742 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GCNT1Q02742 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCNT1Q02742 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCNT1Q02742 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCNT1Q02742 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCNT1Q02742 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCNT1Q02742 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCNT1Q02742 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCNT1Q02742 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCNT1Q02742 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCNT1Q02742 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCNT1Q02742 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCNT1Q02742 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GCNT1Q02742 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GCNT1Q02742 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GCNT1Q02742 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GCNT1Q02742 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GCNT1Q02742 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GCNT1Q02742 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GCNT1Q02742 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GCNT1Q02742 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GCNT1Q02742 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GCNT1Q02742 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GCNT1Q02742 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GCNT1Q02742 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCNT1Q02742 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCNT1Q02742 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCNT1Q02742 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCNT1Q02742 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GCNT1Q02742 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GCNT1Q02742 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GCNT1Q02742 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCNT1Q02742 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GCNT1Q02742 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GCNT1Q02742 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GCNT1Q02742 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCNT1Q02742 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCNT1Q02742 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCNT1Q02742 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCNT1Q02742 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCNT1Q02742 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GCNT1Q02742 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GCNT1Q02742 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCNT1Q02742 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GCNT1Q02742 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCNT1Q02742 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCNT1Q02742 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GCNT1Q02742 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GCNT1Q02742 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCNT1Q02742 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCNT1Q02742 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCNT1Q02742 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCNT1Q02742 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCNT1Q02742 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCNT1Q02742 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCNT1Q02742 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCNT1Q02742 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCNT1Q02742 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCNT1Q02742 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCNT1Q02742 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCNT1Q02742 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GCNT1Q02742 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms