Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX1Q01196 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX1Q01196 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX1Q01196 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX1Q01196 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX1Q01196 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX1Q01196 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX1Q01196 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX1Q01196 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX1Q01196 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX1Q01196 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX1Q01196 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX1Q01196 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUNX1Q01196 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNX1Q01196 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX1Q01196 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX1Q01196 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX1Q01196 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX1Q01196 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RUNX1Q01196 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUNX1Q01196 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUNX1Q01196 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUNX1Q01196 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RUNX1Q01196 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUNX1Q01196 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNX1Q01196 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNX1Q01196 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX1Q01196 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX1Q01196 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX1Q01196 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX1Q01196 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX1Q01196 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX1Q01196 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX1Q01196 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX1Q01196 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX1Q01196 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX1Q01196 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX1Q01196 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX1Q01196 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX1Q01196 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX1Q01196 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX1Q01196 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX1Q01196 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX1Q01196 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX1Q01196 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX1Q01196 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX1Q01196 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX1Q01196 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX1Q01196 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX1Q01196 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX1Q01196 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX1Q01196 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX1Q01196 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX1Q01196 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX1Q01196 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX1Q01196 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX1Q01196 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX1Q01196 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX1Q01196 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX1Q01196 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX1Q01196 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX1Q01196 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX1Q01196 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX1Q01196 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX1Q01196 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX1Q01196 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX1Q01196 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX1Q01196 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX1Q01196 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX1Q01196 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RUNX1Q01196 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX1Q01196 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms