Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBA4AP68366 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBA4AP68366 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBA4AP68366 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBA4AP68366 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBA4AP68366 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBA4AP68366 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBA4AP68366 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBA4AP68366 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBA4AP68366 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBA4AP68366 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBA4AP68366 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBA4AP68366 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBA4AP68366 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBA4AP68366 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBA4AP68366 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBA4AP68366 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBA4AP68366 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBA4AP68366 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBA4AP68366 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBA4AP68366 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBA4AP68366 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBA4AP68366 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBA4AP68366 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBA4AP68366 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBA4AP68366 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBA4AP68366 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBA4AP68366 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBA4AP68366 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBA4AP68366 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBA4AP68366 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBA4AP68366 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBA4AP68366 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBA4AP68366 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBA4AP68366 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBA4AP68366 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBA4AP68366 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBA4AP68366 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBA4AP68366 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBA4AP68366 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBA4AP68366 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBA4AP68366 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBA4AP68366 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBA4AP68366 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBA4AP68366 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBA4AP68366 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBA4AP68366 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBA4AP68366 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBA4AP68366 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBA4AP68366 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBA4AP68366 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBA4AP68366 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBA4AP68366 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBA4AP68366 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBA4AP68366 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBA4AP68366 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBA4AP68366 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBA4AP68366 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBA4AP68366 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBA4AP68366 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBA4AP68366 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBA4AP68366 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBA4AP68366 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBA4AP68366 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA4AP68366 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA4AP68366 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA4AP68366 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBA4AP68366 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBA4AP68366 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBA4AP68366 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBA4AP68366 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBA4AP68366 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBA4AP68366 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBA4AP68366 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBA4AP68366 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBA4AP68366 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBA4AP68366 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBA4AP68366 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBA4AP68366 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBA4AP68366 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBA4AP68366 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBA4AP68366 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBA4AP68366 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBA4AP68366 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBA4AP68366 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBA4AP68366 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBA4AP68366 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBA4AP68366 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBA4AP68366 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBA4AP68366 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBA4AP68366 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA4AP68366 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA4AP68366 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA4AP68366 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBA4AP68366 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBA4AP68366 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBA4AP68366 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBA4AP68366 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBA4AP68366 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBA4AP68366 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms