Protein–RNA interactions for Protein: P63146

UBE2B, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 B, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2BP63146 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2BP63146 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2BP63146 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2BP63146 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2BP63146 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2BP63146 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2BP63146 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2BP63146 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2BP63146 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2BP63146 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2BP63146 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2BP63146 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2BP63146 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2BP63146 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2BP63146 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2BP63146 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2BP63146 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2BP63146 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2BP63146 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2BP63146 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2BP63146 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2BP63146 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2BP63146 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2BP63146 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2BP63146 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2BP63146 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2BP63146 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2BP63146 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBE2BP63146 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2BP63146 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2BP63146 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2BP63146 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2BP63146 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2BP63146 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2BP63146 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2BP63146 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2BP63146 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2BP63146 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2BP63146 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2BP63146 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2BP63146 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2BP63146 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2BP63146 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2BP63146 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2BP63146 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2BP63146 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2BP63146 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2BP63146 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2BP63146 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2BP63146 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2BP63146 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2BP63146 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2BP63146 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2BP63146 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2BP63146 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2BP63146 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2BP63146 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2BP63146 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2BP63146 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms