Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P63121 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERVK_113P63121 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63121 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63121 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63121 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63121 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63121 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63121 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63121 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P63121 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P63121 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P63121 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P63121 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63121 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63121 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P63121 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P63121 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P63121 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P63121 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P63121 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P63121 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P63121 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P63121 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P63121 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P63121 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P63121 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P63121 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P63121 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P63121 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HERVK_113P63121 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms