Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXW4P57775 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXW4P57775 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXW4P57775 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXW4P57775 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXW4P57775 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXW4P57775 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXW4P57775 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXW4P57775 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXW4P57775 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXW4P57775 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXW4P57775 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXW4P57775 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXW4P57775 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXW4P57775 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXW4P57775 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXW4P57775 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXW4P57775 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXW4P57775 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXW4P57775 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXW4P57775 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXW4P57775 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXW4P57775 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXW4P57775 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXW4P57775 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXW4P57775 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXW4P57775 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXW4P57775 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXW4P57775 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXW4P57775 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXW4P57775 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXW4P57775 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXW4P57775 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXW4P57775 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXW4P57775 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXW4P57775 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXW4P57775 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXW4P57775 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXW4P57775 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXW4P57775 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXW4P57775 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXW4P57775 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXW4P57775 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXW4P57775 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXW4P57775 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXW4P57775 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXW4P57775 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXW4P57775 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXW4P57775 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXW4P57775 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXW4P57775 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXW4P57775 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXW4P57775 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXW4P57775 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXW4P57775 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXW4P57775 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXW4P57775 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXW4P57775 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXW4P57775 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXW4P57775 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXW4P57775 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXW4P57775 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXW4P57775 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXW4P57775 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXW4P57775 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXW4P57775 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXW4P57775 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXW4P57775 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXW4P57775 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXW4P57775 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXW4P57775 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXW4P57775 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXW4P57775 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXW4P57775 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXW4P57775 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXW4P57775 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXW4P57775 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXW4P57775 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXW4P57775 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXW4P57775 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXW4P57775 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXW4P57775 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXW4P57775 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXW4P57775 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FBXW4P57775 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FBXW4P57775 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXW4P57775 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXW4P57775 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXW4P57775 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXW4P57775 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXW4P57775 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXW4P57775 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXW4P57775 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXW4P57775 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXW4P57775 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXW4P57775 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXW4P57775 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXW4P57775 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXW4P57775 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXW4P57775 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms