Protein–RNA interactions for Protein: P56557

TMEM50B, Transmembrane protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM50BP56557 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM50BP56557 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM50BP56557 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM50BP56557 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM50BP56557 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM50BP56557 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM50BP56557 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM50BP56557 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM50BP56557 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM50BP56557 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM50BP56557 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM50BP56557 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM50BP56557 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM50BP56557 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM50BP56557 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM50BP56557 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM50BP56557 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM50BP56557 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM50BP56557 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM50BP56557 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM50BP56557 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM50BP56557 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM50BP56557 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM50BP56557 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM50BP56557 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM50BP56557 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM50BP56557 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM50BP56557 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM50BP56557 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM50BP56557 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM50BP56557 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM50BP56557 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM50BP56557 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM50BP56557 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM50BP56557 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM50BP56557 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM50BP56557 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM50BP56557 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM50BP56557 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM50BP56557 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM50BP56557 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM50BP56557 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM50BP56557 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM50BP56557 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM50BP56557 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM50BP56557 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM50BP56557 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM50BP56557 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM50BP56557 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM50BP56557 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM50BP56557 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM50BP56557 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM50BP56557 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM50BP56557 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM50BP56557 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM50BP56557 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM50BP56557 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM50BP56557 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM50BP56557 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM50BP56557 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM50BP56557 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM50BP56557 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM50BP56557 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMEM50BP56557 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms