Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNU13P55769 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNU13P55769 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNU13P55769 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNU13P55769 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNU13P55769 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SNU13P55769 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNU13P55769 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNU13P55769 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNU13P55769 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNU13P55769 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNU13P55769 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNU13P55769 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNU13P55769 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNU13P55769 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNU13P55769 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNU13P55769 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNU13P55769 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNU13P55769 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNU13P55769 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNU13P55769 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNU13P55769 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNU13P55769 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNU13P55769 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNU13P55769 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNU13P55769 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNU13P55769 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNU13P55769 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNU13P55769 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNU13P55769 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNU13P55769 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNU13P55769 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNU13P55769 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNU13P55769 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNU13P55769 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNU13P55769 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNU13P55769 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNU13P55769 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNU13P55769 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNU13P55769 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNU13P55769 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNU13P55769 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNU13P55769 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNU13P55769 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNU13P55769 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNU13P55769 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNU13P55769 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNU13P55769 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNU13P55769 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNU13P55769 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNU13P55769 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNU13P55769 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNU13P55769 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNU13P55769 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNU13P55769 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNU13P55769 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNU13P55769 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNU13P55769 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SNU13P55769 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNU13P55769 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNU13P55769 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNU13P55769 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNU13P55769 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNU13P55769 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNU13P55769 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNU13P55769 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNU13P55769 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNU13P55769 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNU13P55769 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNU13P55769 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNU13P55769 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SNU13P55769 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNU13P55769 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNU13P55769 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNU13P55769 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNU13P55769 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNU13P55769 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNU13P55769 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNU13P55769 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNU13P55769 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNU13P55769 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNU13P55769 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SNU13P55769 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNU13P55769 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNU13P55769 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNU13P55769 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNU13P55769 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNU13P55769 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNU13P55769 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNU13P55769 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNU13P55769 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNU13P55769 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNU13P55769 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNU13P55769 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNU13P55769 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNU13P55769 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNU13P55769 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNU13P55769 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SNU13P55769 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNU13P55769 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132 ms