Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD23AP54725 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD23AP54725 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD23AP54725 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD23AP54725 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD23AP54725 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD23AP54725 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD23AP54725 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD23AP54725 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD23AP54725 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD23AP54725 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD23AP54725 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD23AP54725 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD23AP54725 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD23AP54725 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD23AP54725 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD23AP54725 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAD23AP54725 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAD23AP54725 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD23AP54725 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD23AP54725 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD23AP54725 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD23AP54725 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD23AP54725 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD23AP54725 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD23AP54725 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD23AP54725 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD23AP54725 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD23AP54725 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD23AP54725 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD23AP54725 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD23AP54725 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD23AP54725 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD23AP54725 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD23AP54725 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD23AP54725 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD23AP54725 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD23AP54725 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD23AP54725 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD23AP54725 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAD23AP54725 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD23AP54725 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD23AP54725 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD23AP54725 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD23AP54725 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD23AP54725 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD23AP54725 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD23AP54725 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD23AP54725 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD23AP54725 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD23AP54725 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD23AP54725 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD23AP54725 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD23AP54725 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD23AP54725 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD23AP54725 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD23AP54725 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD23AP54725 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD23AP54725 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD23AP54725 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD23AP54725 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD23AP54725 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD23AP54725 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD23AP54725 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD23AP54725 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD23AP54725 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD23AP54725 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD23AP54725 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD23AP54725 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD23AP54725 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD23AP54725 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD23AP54725 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD23AP54725 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD23AP54725 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD23AP54725 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD23AP54725 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD23AP54725 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD23AP54725 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD23AP54725 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD23AP54725 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD23AP54725 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD23AP54725 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD23AP54725 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD23AP54725 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD23AP54725 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD23AP54725 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD23AP54725 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD23AP54725 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD23AP54725 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD23AP54725 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD23AP54725 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD23AP54725 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD23AP54725 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD23AP54725 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD23AP54725 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD23AP54725 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD23AP54725 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD23AP54725 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD23AP54725 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD23AP54725 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms