Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBX2P52951 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBX2P52951 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBX2P52951 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBX2P52951 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBX2P52951 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBX2P52951 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBX2P52951 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBX2P52951 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBX2P52951 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBX2P52951 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBX2P52951 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBX2P52951 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBX2P52951 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBX2P52951 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBX2P52951 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBX2P52951 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBX2P52951 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GBX2P52951 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBX2P52951 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBX2P52951 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBX2P52951 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBX2P52951 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBX2P52951 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBX2P52951 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBX2P52951 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBX2P52951 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBX2P52951 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBX2P52951 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBX2P52951 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBX2P52951 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBX2P52951 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBX2P52951 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBX2P52951 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBX2P52951 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBX2P52951 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBX2P52951 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBX2P52951 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBX2P52951 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBX2P52951 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBX2P52951 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBX2P52951 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBX2P52951 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GBX2P52951 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GBX2P52951 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBX2P52951 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBX2P52951 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBX2P52951 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBX2P52951 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBX2P52951 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBX2P52951 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBX2P52951 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GBX2P52951 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBX2P52951 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GBX2P52951 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBX2P52951 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBX2P52951 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBX2P52951 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBX2P52951 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBX2P52951 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBX2P52951 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBX2P52951 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBX2P52951 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBX2P52951 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBX2P52951 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBX2P52951 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBX2P52951 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBX2P52951 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBX2P52951 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GBX2P52951 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBX2P52951 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBX2P52951 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBX2P52951 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBX2P52951 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBX2P52951 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBX2P52951 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBX2P52951 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBX2P52951 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBX2P52951 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBX2P52951 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBX2P52951 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBX2P52951 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBX2P52951 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBX2P52951 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBX2P52951 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBX2P52951 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBX2P52951 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBX2P52951 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBX2P52951 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBX2P52951 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBX2P52951 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBX2P52951 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBX2P52951 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBX2P52951 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBX2P52951 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBX2P52951 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBX2P52951 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBX2P52951 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBX2P52951 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBX2P52951 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms