Protein–RNA interactions for Protein: P52735

VAV2, Guanine nucleotide exchange factor VAV2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV2P52735 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAV2P52735 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAV2P52735 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAV2P52735 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAV2P52735 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VAV2P52735 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VAV2P52735 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VAV2P52735 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VAV2P52735 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
VAV2P52735 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VAV2P52735 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VAV2P52735 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VAV2P52735 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VAV2P52735 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VAV2P52735 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VAV2P52735 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VAV2P52735 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VAV2P52735 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VAV2P52735 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VAV2P52735 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VAV2P52735 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VAV2P52735 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VAV2P52735 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
VAV2P52735 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VAV2P52735 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VAV2P52735 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VAV2P52735 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VAV2P52735 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VAV2P52735 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VAV2P52735 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
VAV2P52735 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VAV2P52735 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VAV2P52735 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VAV2P52735 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VAV2P52735 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VAV2P52735 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VAV2P52735 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VAV2P52735 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VAV2P52735 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VAV2P52735 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VAV2P52735 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VAV2P52735 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAV2P52735 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAV2P52735 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAV2P52735 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAV2P52735 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAV2P52735 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAV2P52735 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAV2P52735 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VAV2P52735 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VAV2P52735 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VAV2P52735 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VAV2P52735 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VAV2P52735 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VAV2P52735 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VAV2P52735 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VAV2P52735 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VAV2P52735 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VAV2P52735 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VAV2P52735 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
VAV2P52735 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VAV2P52735 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VAV2P52735 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VAV2P52735 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VAV2P52735 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VAV2P52735 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VAV2P52735 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VAV2P52735 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VAV2P52735 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VAV2P52735 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VAV2P52735 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VAV2P52735 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
VAV2P52735 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VAV2P52735 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VAV2P52735 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VAV2P52735 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
VAV2P52735 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
VAV2P52735 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VAV2P52735 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VAV2P52735 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VAV2P52735 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VAV2P52735 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VAV2P52735 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VAV2P52735 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VAV2P52735 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VAV2P52735 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VAV2P52735 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VAV2P52735 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VAV2P52735 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VAV2P52735 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
VAV2P52735 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VAV2P52735 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VAV2P52735 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VAV2P52735 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VAV2P52735 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VAV2P52735 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VAV2P52735 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VAV2P52735 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VAV2P52735 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
VAV2P52735 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms