Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB2P49721 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB2P49721 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB2P49721 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB2P49721 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB2P49721 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB2P49721 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB2P49721 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB2P49721 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB2P49721 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB2P49721 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB2P49721 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB2P49721 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB2P49721 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB2P49721 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB2P49721 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB2P49721 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB2P49721 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB2P49721 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB2P49721 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB2P49721 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB2P49721 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB2P49721 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB2P49721 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB2P49721 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMB2P49721 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB2P49721 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB2P49721 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB2P49721 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB2P49721 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB2P49721 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB2P49721 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB2P49721 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB2P49721 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB2P49721 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB2P49721 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB2P49721 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB2P49721 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB2P49721 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB2P49721 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB2P49721 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB2P49721 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB2P49721 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB2P49721 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB2P49721 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB2P49721 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB2P49721 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB2P49721 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB2P49721 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB2P49721 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB2P49721 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB2P49721 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB2P49721 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB2P49721 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB2P49721 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB2P49721 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB2P49721 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB2P49721 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB2P49721 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB2P49721 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB2P49721 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB2P49721 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB2P49721 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB2P49721 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB2P49721 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB2P49721 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB2P49721 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB2P49721 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms