Protein–RNA interactions for Protein: P49720

PSMB3, Proteasome subunit beta type-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB3P49720 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMB3P49720 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMB3P49720 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMB3P49720 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMB3P49720 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMB3P49720 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMB3P49720 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMB3P49720 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMB3P49720 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMB3P49720 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB3P49720 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB3P49720 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB3P49720 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB3P49720 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB3P49720 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB3P49720 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB3P49720 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB3P49720 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB3P49720 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB3P49720 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB3P49720 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB3P49720 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB3P49720 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB3P49720 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB3P49720 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB3P49720 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB3P49720 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB3P49720 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB3P49720 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB3P49720 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB3P49720 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB3P49720 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB3P49720 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB3P49720 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB3P49720 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB3P49720 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB3P49720 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB3P49720 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB3P49720 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB3P49720 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB3P49720 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB3P49720 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB3P49720 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB3P49720 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB3P49720 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB3P49720 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB3P49720 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB3P49720 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB3P49720 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB3P49720 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB3P49720 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB3P49720 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB3P49720 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB3P49720 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB3P49720 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB3P49720 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB3P49720 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB3P49720 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB3P49720 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB3P49720 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB3P49720 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB3P49720 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB3P49720 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB3P49720 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB3P49720 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB3P49720 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB3P49720 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB3P49720 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB3P49720 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB3P49720 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB3P49720 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB3P49720 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB3P49720 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB3P49720 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMB3P49720 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMB3P49720 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSMB3P49720 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB3P49720 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB3P49720 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB3P49720 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB3P49720 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB3P49720 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB3P49720 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB3P49720 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB3P49720 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB3P49720 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB3P49720 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB3P49720 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB3P49720 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB3P49720 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB3P49720 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB3P49720 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB3P49720 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB3P49720 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB3P49720 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB3P49720 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB3P49720 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB3P49720 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB3P49720 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB3P49720 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms