Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP9P49458 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP9P49458 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP9P49458 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP9P49458 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP9P49458 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRP9P49458 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRP9P49458 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP9P49458 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP9P49458 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP9P49458 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP9P49458 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP9P49458 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP9P49458 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP9P49458 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP9P49458 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP9P49458 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP9P49458 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP9P49458 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP9P49458 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP9P49458 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP9P49458 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP9P49458 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP9P49458 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP9P49458 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP9P49458 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP9P49458 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRP9P49458 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRP9P49458 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRP9P49458 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SRP9P49458 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRP9P49458 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRP9P49458 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRP9P49458 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SRP9P49458 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRP9P49458 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRP9P49458 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRP9P49458 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRP9P49458 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRP9P49458 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRP9P49458 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRP9P49458 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRP9P49458 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SRP9P49458 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRP9P49458 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRP9P49458 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRP9P49458 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRP9P49458 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRP9P49458 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRP9P49458 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRP9P49458 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRP9P49458 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRP9P49458 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SRP9P49458 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRP9P49458 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRP9P49458 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRP9P49458 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRP9P49458 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRP9P49458 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRP9P49458 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRP9P49458 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRP9P49458 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRP9P49458 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP9P49458 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP9P49458 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP9P49458 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP9P49458 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP9P49458 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP9P49458 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP9P49458 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SRP9P49458 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRP9P49458 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRP9P49458 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SRP9P49458 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRP9P49458 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRP9P49458 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRP9P49458 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRP9P49458 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRP9P49458 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRP9P49458 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRP9P49458 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRP9P49458 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRP9P49458 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRP9P49458 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRP9P49458 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRP9P49458 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRP9P49458 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRP9P49458 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRP9P49458 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRP9P49458 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRP9P49458 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRP9P49458 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRP9P49458 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRP9P49458 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRP9P49458 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRP9P49458 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRP9P49458 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRP9P49458 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRP9P49458 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRP9P49458 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms