Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GABRB2P47870 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GABRB2P47870 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GABRB2P47870 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GABRB2P47870 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GABRB2P47870 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GABRB2P47870 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GABRB2P47870 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GABRB2P47870 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GABRB2P47870 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GABRB2P47870 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GABRB2P47870 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GABRB2P47870 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GABRB2P47870 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GABRB2P47870 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GABRB2P47870 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GABRB2P47870 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GABRB2P47870 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GABRB2P47870 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GABRB2P47870 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GABRB2P47870 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABRB2P47870 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABRB2P47870 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABRB2P47870 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABRB2P47870 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABRB2P47870 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABRB2P47870 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GABRB2P47870 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABRB2P47870 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GABRB2P47870 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GABRB2P47870 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GABRB2P47870 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GABRB2P47870 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GABRB2P47870 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GABRB2P47870 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GABRB2P47870 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GABRB2P47870 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GABRB2P47870 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GABRB2P47870 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GABRB2P47870 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GABRB2P47870 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GABRB2P47870 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GABRB2P47870 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GABRB2P47870 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GABRB2P47870 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GABRB2P47870 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GABRB2P47870 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GABRB2P47870 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GABRB2P47870 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GABRB2P47870 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GABRB2P47870 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GABRB2P47870 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GABRB2P47870 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GABRB2P47870 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GABRB2P47870 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GABRB2P47870 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GABRB2P47870 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GABRB2P47870 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GABRB2P47870 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GABRB2P47870 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GABRB2P47870 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GABRB2P47870 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GABRB2P47870 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GABRB2P47870 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GABRB2P47870 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GABRB2P47870 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GABRB2P47870 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GABRB2P47870 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GABRB2P47870 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GABRB2P47870 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GABRB2P47870 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GABRB2P47870 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GABRB2P47870 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GABRB2P47870 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GABRB2P47870 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GABRB2P47870 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GABRB2P47870 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GABRB2P47870 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GABRB2P47870 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GABRB2P47870 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GABRB2P47870 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GABRB2P47870 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GABRB2P47870 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABRB2P47870 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABRB2P47870 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GABRB2P47870 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GABRB2P47870 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GABRB2P47870 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GABRB2P47870 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GABRB2P47870 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GABRB2P47870 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GABRB2P47870 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GABRB2P47870 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GABRB2P47870 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GABRB2P47870 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GABRB2P47870 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GABRB2P47870 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GABRB2P47870 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GABRB2P47870 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GABRB2P47870 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms